Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARHL1Q9BZE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARHL1Q9BZE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BARHL1Q9BZE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BARHL1Q9BZE3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BARHL1Q9BZE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BARHL1Q9BZE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BARHL1Q9BZE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BARHL1Q9BZE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms