Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM109Q9BVC6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM109Q9BVC6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM109Q9BVC6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM109Q9BVC6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM109Q9BVC6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM109Q9BVC6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM109Q9BVC6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM109Q9BVC6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM109Q9BVC6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms