Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNBD2Q96M20 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD2Q96M20 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNBD2Q96M20 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNBD2Q96M20 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNBD2Q96M20 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNBD2Q96M20 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD2Q96M20 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNBD2Q96M20 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD2Q96M20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNBD2Q96M20 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNBD2Q96M20 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms