Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTSF1Q8WW33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTSF1Q8WW33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTSF1Q8WW33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTSF1Q8WW33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTSF1Q8WW33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTSF1Q8WW33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTSF1Q8WW33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms