Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX06

REXO1L1P, Putative exonuclease GOR, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO1L1PQ8IX06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
REXO1L1PQ8IX06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
REXO1L1PQ8IX06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
REXO1L1PQ8IX06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
REXO1L1PQ8IX06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
REXO1L1PQ8IX06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
REXO1L1PQ8IX06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
REXO1L1PQ8IX06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
REXO1L1PQ8IX06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
REXO1L1PQ8IX06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REXO1L1PQ8IX06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
REXO1L1PQ8IX06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
REXO1L1PQ8IX06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
REXO1L1PQ8IX06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
REXO1L1PQ8IX06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
REXO1L1PQ8IX06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms