Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED4Q7Z7H5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED4Q7Z7H5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED4Q7Z7H5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED4Q7Z7H5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED4Q7Z7H5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMED4Q7Z7H5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED4Q7Z7H5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED4Q7Z7H5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms