Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
STRCQ7RTU9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.4■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
STRCQ7RTU9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
STRCQ7RTU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
STRCQ7RTU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
STRCQ7RTU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
STRCQ7RTU9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
STRCQ7RTU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
STRCQ7RTU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
STRCQ7RTU9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
STRCQ7RTU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
STRCQ7RTU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
STRCQ7RTU9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
STRCQ7RTU9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
STRCQ7RTU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
STRCQ7RTU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
STRCQ7RTU9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
STRCQ7RTU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
STRCQ7RTU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
STRCQ7RTU9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.98■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
STRCQ7RTU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
STRCQ7RTU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
STRCQ7RTU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
STRCQ7RTU9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
STRCQ7RTU9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
STRCQ7RTU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
STRCQ7RTU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
STRCQ7RTU9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
STRCQ7RTU9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
STRCQ7RTU9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms