Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX7Q7RTT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX7Q7RTT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSX7Q7RTT5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSX7Q7RTT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSX7Q7RTT5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSX7Q7RTT5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX7Q7RTT5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms