Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00173Q6ZV60 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00173Q6ZV60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00173Q6ZV60 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00173Q6ZV60 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00173Q6ZV60 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00173Q6ZV60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC00173Q6ZV60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms