Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SRCAPQ6ZRS2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SRCAPQ6ZRS2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SRCAPQ6ZRS2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SRCAPQ6ZRS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SRCAPQ6ZRS2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SRCAPQ6ZRS2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SRCAPQ6ZRS2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SRCAPQ6ZRS2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SRCAPQ6ZRS2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SRCAPQ6ZRS2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SRCAPQ6ZRS2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SRCAPQ6ZRS2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SRCAPQ6ZRS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SRCAPQ6ZRS2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SRCAPQ6ZRS2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SRCAPQ6ZRS2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SRCAPQ6ZRS2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SRCAPQ6ZRS2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SRCAPQ6ZRS2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SRCAPQ6ZRS2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SRCAPQ6ZRS2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SRCAPQ6ZRS2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SRCAPQ6ZRS2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SRCAPQ6ZRS2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SRCAPQ6ZRS2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SRCAPQ6ZRS2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SRCAPQ6ZRS2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
SRCAPQ6ZRS2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SRCAPQ6ZRS2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms