Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DPPA3Q6W0C5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPPA3Q6W0C5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPPA3Q6W0C5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPPA3Q6W0C5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPPA3Q6W0C5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPPA3Q6W0C5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DPPA3Q6W0C5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms