Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AAGABQ6PD74 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AAGABQ6PD74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AAGABQ6PD74 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
AAGABQ6PD74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AAGABQ6PD74 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AAGABQ6PD74 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AAGABQ6PD74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AAGABQ6PD74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms