Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LPCAT4Q643R3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LPCAT4Q643R3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LPCAT4Q643R3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LPCAT4Q643R3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPCAT4Q643R3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LPCAT4Q643R3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPCAT4Q643R3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LPCAT4Q643R3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LPCAT4Q643R3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LPCAT4Q643R3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LPCAT4Q643R3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LPCAT4Q643R3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms