Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAPPA-AS1Q5QFB9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPPA-AS1Q5QFB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms