Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C4orf46Q504U0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4orf46Q504U0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf46Q504U0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf46Q504U0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf46Q504U0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4orf46Q504U0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf46Q504U0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf46Q504U0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms