Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC36A3Q495N2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC36A3Q495N2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC36A3Q495N2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC36A3Q495N2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC36A3Q495N2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A3Q495N2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC36A3Q495N2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A3Q495N2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC36A3Q495N2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms