Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKOR2Q2VWA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKOR2Q2VWA4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKOR2Q2VWA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SKOR2Q2VWA4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SKOR2Q2VWA4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SKOR2Q2VWA4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKOR2Q2VWA4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SKOR2Q2VWA4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SKOR2Q2VWA4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SKOR2Q2VWA4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
SKOR2Q2VWA4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SKOR2Q2VWA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SKOR2Q2VWA4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SKOR2Q2VWA4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SKOR2Q2VWA4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SKOR2Q2VWA4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SKOR2Q2VWA4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
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