Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF9Q13886 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF9Q13886 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF9Q13886 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF9Q13886 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF9Q13886 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF9Q13886 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF9Q13886 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF9Q13886 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF9Q13886 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF9Q13886 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF9Q13886 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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