Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPBGQ13641 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPBGQ13641 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPBGQ13641 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPBGQ13641 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPBGQ13641 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPBGQ13641 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPBGQ13641 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPBGQ13641 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPBGQ13641 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPBGQ13641 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPBGQ13641 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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