Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 RET2YFR051C 1641 nt9.53□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 HSL7YBR133C 2484 nt9.53□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 SFA1YDL168W 1161 nt9.52□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 ALD4YOR374W 1560 nt9.51□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 HIF1YLL022C 1158 nt9.51□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 YML089CYML089C 369 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 UBA4YHR111W 1323 nt9.5□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 YAT1YAR035W 2064 nt9.49□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 UBX6YJL048C 1191 nt9.49□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 ATG15YCR068W 1563 nt9.49□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 NDI1YML120C 1542 nt9.48□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 THI74YDR438W 1113 nt9.47□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 SAM35YHR083W 990 nt9.47□□□□□ -0.89
RPN6Q12377 PHO89YBR296C 1725 nt9.45□□□□□ -0.9
RPN6Q12377 TOM6YOR045W 186 nt9.45□□□□□ -0.9
RPN6Q12377 YSR3YKR053C 1215 nt9.43□□□□□ -0.9
RPN6Q12377 NAT4YMR069W 858 nt9.41□□□□□ -0.9
RPN6Q12377 DIF1YLR437C 402 nt9.4□□□□□ -0.9
RPN6Q12377 YCR087WYCR087W 516 nt9.39□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 MSF1YPR047W 1410 nt9.39□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 COQ2YNR041C 1119 nt9.38□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 TIF6YPR016C 738 nt9.38□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 PEX2YJL210W 816 nt9.37□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 HIP1YGR191W 1812 nt9.37□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 MRP20YDR405W 792 nt9.36□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 SPT20YOL148C 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
RPN6Q12377 XYL2YLR070C 1071 nt9.33□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.32□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.32□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 ZRT3YKL175W 1512 nt9.32□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 DBP1YPL119C 1854 nt9.32□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 YGL034CYGL034C 366 nt9.31□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 MET28YIR017C 564 nt9.31□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 HXT1YHR094C 1713 nt9.29□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 YAR028WYAR028W 705 nt9.29□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 AIM45YPR004C 1035 nt9.29□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 RPL4BYDR012W 1089 nt9.28□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 RPL4AYBR031W 1089 nt9.28□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 INA1YLR413W 2028 nt9.27□□□□□ -0.92
RPN6Q12377 CLB6YGR109C 1143 nt9.27□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 UTH1YKR042W 1098 nt9.27□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 HEL2YDR266C 1920 nt9.26□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 NRT1YOR071C 1797 nt9.25□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 RPC82YPR190C 1965 nt9.25□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 SED1YDR077W 1017 nt9.23□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.23□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 MTG2YHR168W 1557 nt9.22□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 RPS14BYJL191W 417 nt9.22□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 LIP1YMR298W 453 nt9.22□□□□□ -0.93
RPN6Q12377 SHY1YGR112W 1170 nt9.21□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YJL067WYJL067W 351 nt9.21□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 FIT3YOR383C 615 nt9.21□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.2□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 YBL086CYBL086C 1401 nt9.2□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 ALP1YNL270C 1722 nt9.18□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 AKR2YOR034C 2250 nt9.17□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 RBG1YAL036C 1110 nt9.16□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 RIM8YGL045W 1629 nt9.16□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 ZTA1YBR046C 1005 nt9.15□□□□□ -0.94
RPN6Q12377 LEU9YOR108W 1815 nt9.14□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 URA6YKL024C 615 nt9.12□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 SAM1YLR180W 1149 nt9.12□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 UFO1YML088W 2007 nt9.1□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 SSN3YPL042C 1668 nt9.1□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 YPL251WYPL251W 303 nt9.1□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 YGL114WYGL114W 2178 nt9.1□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 BRR1YPR057W 1026 nt9.09□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 TSC10YBR265W 963 nt9.09□□□□□ -0.95
RPN6Q12377 TOA2YKL058W 369 nt9.07□□□□□ -0.96
RPN6Q12377 MUP1YGR055W 1725 nt9.07□□□□□ -0.96
RPN6Q12377 SBA1YKL117W 651 nt9.05□□□□□ -0.96
RPN6Q12377 YLR279WYLR279W 390 nt9.05□□□□□ -0.96
RPN6Q12377 OYE3YPL171C 1203 nt9.03□□□□□ -0.96
RPN6Q12377 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.02□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 GND2YGR256W 1479 nt9.02□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 YGR012WYGR012W 1182 nt9.01□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 PET8YNL003C 855 nt9.01□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 SDH5YOL071W 489 nt9.01□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 ILV3YJR016C 1758 nt9.01□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 MET2YNL277W 1461 nt9.01□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 CWC15YDR163W 528 nt9□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 YMR103CYMR103C 363 nt9□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 MEP3YPR138C 1470 nt9□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.99□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 MSB4YOL112W 1479 nt8.99□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 GID7YCL039W 2238 nt8.98□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 HOL1YNR055C 1761 nt8.98□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 MAE1YKL029C 2010 nt8.97□□□□□ -0.97
RPN6Q12377 UGA4YDL210W 1716 nt8.95□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 YOR325WYOR325W 474 nt8.95□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 YNL024CYNL024C 741 nt8.94□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 RAD23YEL037C 1197 nt8.93□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 FCY21YER060W 1587 nt8.92□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 APT2YDR441C 546 nt8.92□□□□□ -0.98
RPN6Q12377 SAM2YDR502C 1155 nt8.92□□□□□ -0.98
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