Protein–RNA interactions for Protein: Q12368

SNU23, 23 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU23Q12368 YHR218WYHR218W 1812 nt8.36□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.36□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 DUT1YBR252W 444 nt8.36□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 SGA1YIL099W 1650 nt8.36□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 KES1YPL145C 1305 nt8.35□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 MEX67YPL169C 1800 nt8.34□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 RBG1YAL036C 1110 nt8.34□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 GOR1YNL274C 1053 nt8.34□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 OPI10YOL032W 741 nt8.34□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 YPR011CYPR011C 981 nt8.34□□□□□ -1.07
SNU23Q12368 BSP1YPR171W 1731 nt8.32□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 ERV46YAL042W 1248 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 PLB1YMR008C 1995 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 TPN1YGL186C 1740 nt8.31□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 VPS60YDR486C 690 nt8.29□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 YKR040CYKR040C 504 nt8.29□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 AVT6YER119C 1347 nt8.29□□□□□ -1.08
SNU23Q12368 BET2YPR176C 978 nt8.27□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 CCT4YDL143W 1587 nt8.24□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 TOM71YHR117W 1920 nt8.23□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 ZAP1YJL056C 2643 nt8.23□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 SWC5YBR231C 912 nt8.23□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 CCT2YIL142W 1584 nt8.22□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 ODC1YPL134C 933 nt8.22□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 LPD1YFL018C 1500 nt8.22□□□□□ -1.09
SNU23Q12368 UFD1YGR048W 1086 nt8.21□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 LSB5YCL034W 1065 nt8.19□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 YLR179CYLR179C 606 nt8.18□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 DAK2YFL053W 1776 nt8.17□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 TIM23YNR017W 669 nt8.17□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 ARP6YLR085C 1317 nt8.16□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 SAM35YHR083W 990 nt8.15□□□□□ -1.1
SNU23Q12368 LSB6YJL100W 1824 nt8.14□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 HEM14YER014W 1620 nt8.14□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 HXT10YFL011W 1641 nt8.14□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 NBA1YOL070C 1506 nt8.13□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 FIT1YDR534C 1587 nt8.13□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 UTR1YJR049C 1593 nt8.13□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 ALR1YOL130W 2580 nt8.13□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 YRF1-2YER190W 5046 nt8.1□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 AHT1YHR093W 549 nt8.1□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 SFL1YOR140W 2301 nt8.09□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 FRA1YLL029W 2250 nt8.09□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 CWC15YDR163W 528 nt8.09□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 YLR235CYLR235C 399 nt8.09□□□□□ -1.11
SNU23Q12368 MDM35YKL053C-A 261 nt8.08□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 PTH1YHR189W 573 nt8.07□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 SSL2YIL143C 2532 nt8.07□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 DAT1YML113W 747 nt8.06□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 MIM1YOL026C 342 nt8.06□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 NBP35YGL091C 987 nt8.04□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 PHO23YNL097C 993 nt8.04□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 NSG2YNL156C 900 nt8.03□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 QDR2YIL121W 1629 nt8.03□□□□□ -1.12
SNU23Q12368 SBA1YKL117W 651 nt8.02□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 YCR102CYCR102C 1107 nt8.01□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 SHY1YGR112W 1170 nt8.01□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 MET30YIL046W 1923 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 MRP20YDR405W 792 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 YPR064WYPR064W 420 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 SHM2YLR058C 1410 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 HXT1YHR094C 1713 nt8□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 SHB17YKR043C 816 nt7.99□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 AGP3YFL055W 1677 nt7.98□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 GID8YMR135C 1368 nt7.98□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 DBP1YPL119C 1854 nt7.97□□□□□ -1.13
SNU23Q12368 YNL190WYNL190W 615 nt7.96□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 HBS1YKR084C 1836 nt7.96□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 GAP1YKR039W 1809 nt7.95□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 TIM17YJL143W 477 nt7.95□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 LSR1LSR1 1175 nt7.95□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 MRS6YOR370C 1812 nt7.94□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 YKL133CYKL133C 1392 nt7.94□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 LSC2YGR244C 1284 nt7.93□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 THI6YPL214C 1623 nt7.92□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 SPP1YPL138C 1062 nt7.92□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 RTG2YGL252C 1767 nt7.92□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 DIG1YPL049C 1359 nt7.91□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 DUS3YLR401C 2007 nt7.91□□□□□ -1.14
SNU23Q12368 NIT1YIL164C 600 nt7.89□□□□□ -1.15
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