Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 RPL4AYBR031W 1089 nt10.48□□□□□ -0.73
HRT3Q12347 YCL074WYCL074W 927 nt10.47□□□□□ -0.73
HRT3Q12347 TIR3YIL011W 810 nt10.47□□□□□ -0.73
HRT3Q12347 RPS14BYJL191W 417 nt10.43□□□□□ -0.74
HRT3Q12347 YLR111WYLR111W 333 nt10.42□□□□□ -0.74
HRT3Q12347 CLB6YGR109C 1143 nt10.41□□□□□ -0.74
HRT3Q12347 STR3YGL184C 1398 nt10.4□□□□□ -0.74
HRT3Q12347 YGR259CYGR259C 441 nt10.4□□□□□ -0.74
HRT3Q12347 SAM1YLR180W 1149 nt10.4□□□□□ -0.74
HRT3Q12347 TOM6YOR045W 186 nt10.39□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 POM34YLR018C 900 nt10.38□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 UTH1YKR042W 1098 nt10.37□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.37□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.37□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 HIP1YGR191W 1812 nt10.36□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 AQY2YLL052C 450 nt10.36□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 NAR1YNL240C 1476 nt10.36□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 SDH5YOL071W 489 nt10.35□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 SNF1YDR477W 1902 nt10.35□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 RAD23YEL037C 1197 nt10.34□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 LSC2YGR244C 1284 nt10.34□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 PEX2YJL210W 816 nt10.34□□□□□ -0.75
HRT3Q12347 YML089CYML089C 369 nt10.33□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 BIO5YNR056C 1686 nt10.33□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 PRO1YDR300C 1287 nt10.32□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 IRC24YIR036C 792 nt10.32□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.3□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 TSC10YBR265W 963 nt10.3□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 NRT1YOR071C 1797 nt10.29□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 CAB5YDR196C 726 nt10.29□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 TIF6YPR016C 738 nt10.28□□□□□ -0.76
HRT3Q12347 YGR012WYGR012W 1182 nt10.27□□□□□ -0.77
HRT3Q12347 MET28YIR017C 564 nt10.26□□□□□ -0.77
HRT3Q12347 ARP6YLR085C 1317 nt10.26□□□□□ -0.77
HRT3Q12347 ATG15YCR068W 1563 nt10.25□□□□□ -0.77
HRT3Q12347 RIB3YDR487C 627 nt10.24□□□□□ -0.77
HRT3Q12347 YLR279WYLR279W 390 nt10.22□□□□□ -0.77
HRT3Q12347 PBP1YGR178C 2169 nt10.21□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 CYT2YKL087C 675 nt10.19□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 GAP1YKR039W 1809 nt10.18□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 RAD51YER095W 1203 nt10.17□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 FIT3YOR383C 615 nt10.17□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 RTN2YDL204W 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 MSB4YOL112W 1479 nt10.16□□□□□ -0.78
HRT3Q12347 PLB1YMR008C 1995 nt10.12□□□□□ -0.79
HRT3Q12347 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.1□□□□□ -0.79
HRT3Q12347 YLR349WYLR349W 507 nt10.08□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 STE4YOR212W 1272 nt10.08□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 FUN14YAL008W 597 nt10.06□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 YJL195CYJL195C 702 nt10.05□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 DIF1YLR437C 402 nt10.05□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 ADH1YOL086C 1047 nt10.05□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 YAR028WYAR028W 705 nt10.03□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 YNR029CYNR029C 1290 nt10.03□□□□□ -0.8
HRT3Q12347 YPI1YFR003C 468 nt10.02□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 ZTA1YBR046C 1005 nt10.01□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 GND1YHR183W 1470 nt10.01□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 ALP1YNL270C 1722 nt10.01□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 MTG2YHR168W 1557 nt10□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 UTR1YJR049C 1593 nt10□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 CMP2YML057W 1815 nt9.99□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 Q0182Q0182 405 nt9.99□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 LOT5YKL183W 921 nt9.99□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 AKR2YOR034C 2250 nt9.97□□□□□ -0.81
HRT3Q12347 ADH7YCR105W 1086 nt9.94□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 RPM1RPM1 483 nt9.93□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 YAT1YAR035W 2064 nt9.93□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 FCY21YER060W 1587 nt9.92□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 APT2YDR441C 546 nt9.9□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 YEL008WYEL008W 381 nt9.9□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 PAU15YIR041W 375 nt9.9□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 SMM1YNR015W 1155 nt9.9□□□□□ -0.82
HRT3Q12347 ALD4YOR374W 1560 nt9.88□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 PRM5YIL117C 957 nt9.87□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 HIF1YLL022C 1158 nt9.87□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 SED1YDR077W 1017 nt9.84□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 SAM35YHR083W 990 nt9.84□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 GPN2YOR262W 1044 nt9.84□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.84□□□□□ -0.83
HRT3Q12347 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.83□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.83□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.83□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.83□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.83□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 CPD1YGR247W 720 nt9.82□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 RIB2YOL066C 1776 nt9.81□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 HXT12YIL170W 1374 nt9.81□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 UGA4YDL210W 1716 nt9.8□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 PRY1YJL079C 900 nt9.8□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 INA1YLR413W 2028 nt9.8□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 SPT20YOL148C 1815 nt9.77□□□□□ -0.84
HRT3Q12347 LIP1YMR298W 453 nt9.77□□□□□ -0.85
HRT3Q12347 ESS1YJR017C 513 nt9.76□□□□□ -0.85
HRT3Q12347 DBP1YPL119C 1854 nt9.74□□□□□ -0.85
HRT3Q12347 VRG4YGL225W 1014 nt9.73□□□□□ -0.85
HRT3Q12347 YPL251WYPL251W 303 nt9.73□□□□□ -0.85
HRT3Q12347 RPC82YPR190C 1965 nt9.72□□□□□ -0.85
HRT3Q12347 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.71□□□□□ -0.86
HRT3Q12347 ZRT3YKL175W 1512 nt9.71□□□□□ -0.86
HRT3Q12347 YBL086CYBL086C 1401 nt9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms