Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 SHB17YKR043C 816 nt8.06□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 POM34YLR018C 900 nt8.06□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 YML089CYML089C 369 nt8.06□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 PRE6YOL038W 765 nt8.06□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 RRT5YFR032C 870 nt8.05□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 HSL7YBR133C 2484 nt8.04□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 YDR010CYDR010C 333 nt8.03□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 ZRT3YKL175W 1512 nt8.03□□□□□ -1.12
YPS3Q12303 SPT20YOL148C 1815 nt8.01□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 TOM6YOR045W 186 nt8.01□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 SFA1YDL168W 1161 nt8□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 RET2YFR051C 1641 nt8□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 PHO89YBR296C 1725 nt7.98□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 RPC82YPR190C 1965 nt7.97□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 DIF1YLR437C 402 nt7.97□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 HXT1YHR094C 1713 nt7.97□□□□□ -1.13
YPS3Q12303 YDR094WYDR094W 336 nt7.96□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 MIR1YJR077C 936 nt7.96□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 UBA4YHR111W 1323 nt7.96□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 SSN3YPL042C 1668 nt7.95□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 PEX2YJL210W 816 nt7.95□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 FRE6YLL051C 2139 nt7.95□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 RDN25-1RDN25-1 3396 nt7.94□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 RDN25-2RDN25-2 3396 nt7.94□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 YSR3YKR053C 1215 nt7.94□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 MRP20YDR405W 792 nt7.93□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 THI74YDR438W 1113 nt7.92□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 DBP1YPL119C 1854 nt7.91□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 YCR087WYCR087W 516 nt7.9□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 YJL067WYJL067W 351 nt7.9□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 TIF6YPR016C 738 nt7.9□□□□□ -1.14
YPS3Q12303 PAU16YKL224C 372 nt7.89□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 YAR028WYAR028W 705 nt7.89□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 LIP1YMR298W 453 nt7.89□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 HIP1YGR191W 1812 nt7.89□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 MET28YIR017C 564 nt7.88□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 COQ2YNR041C 1119 nt7.88□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 SED1YDR077W 1017 nt7.87□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 SHY1YGR112W 1170 nt7.87□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 NAT4YMR069W 858 nt7.87□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 CLB6YGR109C 1143 nt7.86□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.85□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.85□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.85□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.85□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.85□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 NRT1YOR071C 1797 nt7.84□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 XYL2YLR070C 1071 nt7.84□□□□□ -1.15
YPS3Q12303 UTH1YKR042W 1098 nt7.83□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 SAM1YLR180W 1149 nt7.83□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 RPL4BYDR012W 1089 nt7.82□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 YBL086CYBL086C 1401 nt7.82□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 RPL4AYBR031W 1089 nt7.82□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 MSF1YPR047W 1410 nt7.82□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 MTG2YHR168W 1557 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 HEL2YDR266C 1920 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 AKR2YOR034C 2250 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 CWC15YDR163W 528 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 YGL034CYGL034C 366 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 TOA2YKL058W 369 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 GID7YCL039W 2238 nt7.8□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 FIT3YOR383C 615 nt7.79□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 AIM45YPR004C 1035 nt7.79□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 MUP1YGR055W 1725 nt7.78□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 ALP1YNL270C 1722 nt7.78□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 URA6YKL024C 615 nt7.78□□□□□ -1.16
YPS3Q12303 YNL024CYNL024C 741 nt7.77□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.76□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 BRR1YPR057W 1026 nt7.76□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 UBX6YJL048C 1191 nt7.75□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 RIM8YGL045W 1629 nt7.74□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 LEU9YOR108W 1815 nt7.74□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 ZTA1YBR046C 1005 nt7.74□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 RPS14BYJL191W 417 nt7.73□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 PET8YNL003C 855 nt7.73□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 OYE3YPL171C 1203 nt7.73□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 ILV3YJR016C 1758 nt7.73□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 GND2YGR256W 1479 nt7.73□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 SAM2YDR502C 1155 nt7.72□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 UFO1YML088W 2007 nt7.71□□□□□ -1.17
YPS3Q12303 RBG1YAL036C 1110 nt7.71□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 YOR325WYOR325W 474 nt7.71□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 YPL251WYPL251W 303 nt7.71□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 MEP3YPR138C 1470 nt7.7□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 BSP1YPR171W 1731 nt7.7□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 HOL1YNR055C 1761 nt7.7□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.7□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 YMR103CYMR103C 363 nt7.69□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 SDH5YOL071W 489 nt7.66□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 TSC10YBR265W 963 nt7.66□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 CCT2YIL142W 1584 nt7.66□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 SBA1YKL117W 651 nt7.65□□□□□ -1.18
YPS3Q12303 YGL114WYGL114W 2178 nt7.64□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 OPI10YOL032W 741 nt7.64□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 SPP2YOR148C 558 nt7.64□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 NPP1YCR026C 2229 nt7.64□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 MET2YNL277W 1461 nt7.63□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 VPS62YGR141W 1404 nt7.63□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 HIS2YFR025C 1008 nt7.63□□□□□ -1.19
YPS3Q12303 BET2YPR176C 978 nt7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 151.5 ms