Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 MOD5YOR274W 1287 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 BNA2YJR078W 1362 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 SWC5YBR231C 912 nt9.45□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 BDH1YAL060W 1149 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 BMT6YLR063W 1098 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 YML079WYML079W 606 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 AGP1YCL025C 1902 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 YKR005CYKR005C 1578 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 YHP1YDR451C 1062 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 ADO1YJR105W 1023 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 UBC12YLR306W 567 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 ARC19YKL013C 516 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-BLQ12266 GTT3YEL017W 1014 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 NAR1YNL240C 1476 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 YPL041CYPL041C 624 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 MPS2YGL075C 1164 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 MPC1YGL080W 393 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 YGL118CYGL118C 438 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 DUS1YML080W 1272 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 HHO1YPL127C 777 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 YCL074WYCL074W 927 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 PIC2YER053C 903 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 FAR3YMR052W 615 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 SNF1YDR477W 1902 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 BIO5YNR056C 1686 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 YSP3YOR003W 1437 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 YLR415CYLR415C 339 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1A-BLQ12266 YGR259CYGR259C 441 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 FTH1YBR207W 1398 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 ARP6YLR085C 1317 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 COX3Q0275 810 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 YJR154WYJR154W 1041 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 YGR201CYGR201C 678 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 YBL081WYBL081W 1107 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 XDJ1YLR090W 1380 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 COG1YGL223C 1254 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 DUT1YBR252W 444 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 RUF21RUF21 707 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 MRPL36YBR122C 534 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 IRC24YIR036C 792 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 VPS28YPL065W 729 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-BLQ12266 PBP1YGR178C 2169 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 BNA3YJL060W 1335 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 SHM2YLR058C 1410 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 CYT2YKL087C 675 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 PAB1YER165W 1734 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 GDH3YAL062W 1374 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 BNS1YGR230W 414 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 YNL115CYNL115C 1935 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 YFL066CYFL066C 1179 nt9.23□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 YNL234WYNL234W 1281 nt9.23□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 AIM41YOR215C 558 nt9.23□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 PEX25YPL112C 1185 nt9.23□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 YPR1YDR368W 939 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 NAT5YOR253W 531 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 AVT6YER119C 1347 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.21□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.21□□□□□ -0.93
TY1A-BLQ12266 SED5YLR026C 1023 nt9.21□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YLR311CYLR311C 348 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 TSR2YLR435W 618 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 DIA1YMR316W 1011 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YNL040WYNL040W 1371 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YDL157CYDL157C 357 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YFR018CYFR018C 1092 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 NIT1YIL164C 600 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 TIM17YJL143W 477 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 HOS2YGL194C 1359 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 STR3YGL184C 1398 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 PRE6YOL038W 765 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 ICE2YIL090W 1476 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 GOR1YNL274C 1053 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 NEJ1YLR265C 1029 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YTH1YPR107C 627 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-BLQ12266 YDR094WYDR094W 336 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 REC114YMR133W 1287 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 PEX34YCL056C 435 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 APM1YPL259C 1428 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 SGT2YOR007C 1041 nt9.12□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 YGR011WYGR011W 327 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 YHR054CYHR054C 1065 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 NDJ1YOL104C 1059 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 TAZ1YPR140W 1146 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 AQY2YLL052C 450 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 RSA3YLR221C 663 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 DAT1YML113W 747 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 VPS75YNL246W 795 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 SUA5YGL169W 1281 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1A-BLQ12266 RTN2YDL204W 1182 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 AME1YBR211C 975 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 RPM1RPM1 483 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 UBX6YJL048C 1191 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 YMR147WYMR147W 672 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 PCL10YGL134W 1302 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 PUS9YDL036C 1389 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 YDL158CYDL158C 309 nt9.05□□□□□ -0.96
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