Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 SDH5YOL071W 489 nt10.23□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 POM34YLR018C 900 nt10.22□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 RPS14BYJL191W 417 nt10.21□□□□□ -0.77
LCB4Q12246 CLB6YGR109C 1143 nt10.19□□□□□ -0.78
LCB4Q12246 YLR111WYLR111W 333 nt10.19□□□□□ -0.78
LCB4Q12246 YMR226CYMR226C 804 nt10.18□□□□□ -0.78
LCB4Q12246 HIP1YGR191W 1812 nt10.18□□□□□ -0.78
LCB4Q12246 UTH1YKR042W 1098 nt10.16□□□□□ -0.78
LCB4Q12246 ATG15YCR068W 1563 nt10.16□□□□□ -0.78
LCB4Q12246 NRT1YOR071C 1797 nt10.14□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 HSP60YLR259C 1719 nt10.13□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 CAB5YDR196C 726 nt10.13□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 LSC2YGR244C 1284 nt10.12□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 YML089CYML089C 369 nt10.11□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 TIF6YPR016C 738 nt10.11□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 PLB1YMR008C 1995 nt10.09□□□□□ -0.79
LCB4Q12246 ARP6YLR085C 1317 nt10.08□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 YGR012WYGR012W 1182 nt10.08□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 GAP1YKR039W 1809 nt10.07□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 MCH5YOR306C 1566 nt10.06□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 MET28YIR017C 564 nt10.06□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 TSC10YBR265W 963 nt10.06□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 RTN2YDL204W 1182 nt10.05□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 RAD23YEL037C 1197 nt10.05□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 SAM1YLR180W 1149 nt10.04□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 YKR005CYKR005C 1578 nt10.03□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.03□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 ALG12YNR030W 1656 nt10.02□□□□□ -0.8
LCB4Q12246 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.02□□□□□ -0.81
LCB4Q12246 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.02□□□□□ -0.81
LCB4Q12246 YGR259CYGR259C 441 nt10.01□□□□□ -0.81
LCB4Q12246 YLR279WYLR279W 390 nt10.01□□□□□ -0.81
LCB4Q12246 MSB4YOL112W 1479 nt9.99□□□□□ -0.81
LCB4Q12246 RIB3YDR487C 627 nt9.96□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 PRP4YPR178W 1398 nt9.96□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 UTR1YJR049C 1593 nt9.96□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 ZTA1YBR046C 1005 nt9.94□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 DIF1YLR437C 402 nt9.92□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 FIT3YOR383C 615 nt9.92□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.91□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 RAD51YER095W 1203 nt9.9□□□□□ -0.82
LCB4Q12246 DPS1YLL018C 1674 nt9.9□□□□□ -0.83
LCB4Q12246 AKR2YOR034C 2250 nt9.87□□□□□ -0.83
LCB4Q12246 YAR028WYAR028W 705 nt9.87□□□□□ -0.83
LCB4Q12246 MTG2YHR168W 1557 nt9.87□□□□□ -0.83
LCB4Q12246 PRM5YIL117C 957 nt9.86□□□□□ -0.83
LCB4Q12246 BMT6YLR063W 1098 nt9.85□□□□□ -0.83
LCB4Q12246 ALP1YNL270C 1722 nt9.83□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 LOT5YKL183W 921 nt9.82□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 AAC1YMR056C 930 nt9.8□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 ADH1YOL086C 1047 nt9.8□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 GND1YHR183W 1470 nt9.79□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 APT2YDR441C 546 nt9.79□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 YJL195CYJL195C 702 nt9.79□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 STE4YOR212W 1272 nt9.78□□□□□ -0.84
LCB4Q12246 SMM1YNR015W 1155 nt9.77□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 SNF1YDR477W 1902 nt9.76□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 FUN14YAL008W 597 nt9.75□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 NAR1YNL240C 1476 nt9.74□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 YPI1YFR003C 468 nt9.74□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 SAM35YHR083W 990 nt9.74□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 IRC24YIR036C 792 nt9.74□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 YLR349WYLR349W 507 nt9.74□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 YNR029CYNR029C 1290 nt9.74□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 UGA4YDL210W 1716 nt9.72□□□□□ -0.85
LCB4Q12246 SED1YDR077W 1017 nt9.71□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 ADH7YCR105W 1086 nt9.69□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 LIP1YMR298W 453 nt9.69□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 GPN2YOR262W 1044 nt9.69□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 RIB2YOL066C 1776 nt9.68□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 FCY21YER060W 1587 nt9.68□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 BIO5YNR056C 1686 nt9.67□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 PAU15YIR041W 375 nt9.67□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.66□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 PRY1YJL079C 900 nt9.66□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 YPL251WYPL251W 303 nt9.65□□□□□ -0.86
LCB4Q12246 ALD4YOR374W 1560 nt9.64□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 HIF1YLL022C 1158 nt9.63□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 DBP1YPL119C 1854 nt9.63□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 YBL086CYBL086C 1401 nt9.63□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 HXT1YHR094C 1713 nt9.62□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 YJL055WYJL055W 738 nt9.62□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 YMR103CYMR103C 363 nt9.62□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 PBP1YGR178C 2169 nt9.62□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 MEP3YPR138C 1470 nt9.61□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 YEL008WYEL008W 381 nt9.6□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 BRR1YPR057W 1026 nt9.6□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 VRG4YGL225W 1014 nt9.59□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 TOA2YKL058W 369 nt9.59□□□□□ -0.87
LCB4Q12246 RPM1RPM1 483 nt9.58□□□□□ -0.88
LCB4Q12246 LEU9YOR108W 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
LCB4Q12246 GND2YGR256W 1479 nt9.54□□□□□ -0.88
LCB4Q12246 HXT12YIL170W 1374 nt9.54□□□□□ -0.88
LCB4Q12246 CPD1YGR247W 720 nt9.54□□□□□ -0.88
LCB4Q12246 CYT2YKL087C 675 nt9.53□□□□□ -0.88
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