Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 NBP35YGL091C 987 nt9.28□□□□□ -0.92
MSH5Q12175 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.27□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 CYT1YOR065W 930 nt9.26□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 FRE6YLL051C 2139 nt9.26□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 YKL030WYKL030W 606 nt9.25□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 GID7YCL039W 2238 nt9.24□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 ARO8YGL202W 1503 nt9.23□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 DAT1YML113W 747 nt9.23□□□□□ -0.93
MSH5Q12175 TAD3YLR316C 969 nt9.21□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 SHM2YLR058C 1410 nt9.21□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 URA8YJR103W 1737 nt9.2□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 OPI10YOL032W 741 nt9.2□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 KES1YPL145C 1305 nt9.19□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 HXK1YFR053C 1458 nt9.19□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 YCR102CYCR102C 1107 nt9.18□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 SGA1YIL099W 1650 nt9.18□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 DMA2YNL116W 1569 nt9.17□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 BET2YPR176C 978 nt9.16□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 GAP1YKR039W 1809 nt9.15□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 RSC8YFR037C 1674 nt9.15□□□□□ -0.94
MSH5Q12175 ALD5YER073W 1563 nt9.15□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 CCT2YIL142W 1584 nt9.15□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 HXT1YHR094C 1713 nt9.14□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 SHY1YGR112W 1170 nt9.12□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 BDH1YAL060W 1149 nt9.12□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 DBP1YPL119C 1854 nt9.11□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 YLR415CYLR415C 339 nt9.11□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 CWC15YDR163W 528 nt9.1□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 TIM17YJL143W 477 nt9.1□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 NIT1YIL164C 600 nt9.09□□□□□ -0.95
MSH5Q12175 LSC2YGR244C 1284 nt9.07□□□□□ -0.96
MSH5Q12175 ZAP1YJL056C 2643 nt9.05□□□□□ -0.96
MSH5Q12175 MRP20YDR405W 792 nt9.05□□□□□ -0.96
MSH5Q12175 LSB6YJL100W 1824 nt9.05□□□□□ -0.96
MSH5Q12175 YHR218WYHR218W 1812 nt9.04□□□□□ -0.96
MSH5Q12175 BSP1YPR171W 1731 nt9.02□□□□□ -0.96
MSH5Q12175 ESBP6YNL125C 2022 nt9.02□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 SGT2YOR007C 1041 nt9.01□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 YOR072WYOR072W 315 nt9□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 ODC1YPL134C 933 nt9□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 MEP3YPR138C 1470 nt8.98□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 PRO1YDR300C 1287 nt8.98□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 PCP1YGR101W 1041 nt8.98□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 TIR3YIL011W 810 nt8.98□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 URA6YKL024C 615 nt8.98□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 THI72YOR192C 1800 nt8.98□□□□□ -0.97
MSH5Q12175 YSP3YOR003W 1437 nt8.96□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 QDR2YIL121W 1629 nt8.95□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 DIF1YLR437C 402 nt8.95□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.94□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 YBL086CYBL086C 1401 nt8.93□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 ATG15YCR068W 1563 nt8.91□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 UBX6YJL048C 1191 nt8.9□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 SHH4YLR164W 507 nt8.9□□□□□ -0.98
MSH5Q12175 ILV2YMR108W 2064 nt8.9□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 GID8YMR135C 1368 nt8.89□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 LIP1YMR298W 453 nt8.89□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 ZTA1YBR046C 1005 nt8.89□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 RET2YFR051C 1641 nt8.89□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 SSL2YIL143C 2532 nt8.89□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 HXT10YFL011W 1641 nt8.88□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 POM34YLR018C 900 nt8.88□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 MEX67YPL169C 1800 nt8.88□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 UFO1YML088W 2007 nt8.87□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 PET8YNL003C 855 nt8.87□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 MDM35YKL053C-A 261 nt8.86□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 DIG1YPL049C 1359 nt8.86□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 YNL115CYNL115C 1935 nt8.85□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 MRS6YOR370C 1812 nt8.84□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 SHB17YKR043C 816 nt8.84□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 OYE3YPL171C 1203 nt8.84□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 YKL133CYKL133C 1392 nt8.84□□□□□ -0.99
MSH5Q12175 ACH1YBL015W 1581 nt8.83□□□□□ -1
MSH5Q12175 SPP2YOR148C 558 nt8.83□□□□□ -1
MSH5Q12175 RFC1YOR217W 2586 nt8.83□□□□□ -1
MSH5Q12175 GTB1YDR221W 2109 nt8.83□□□□□ -1
MSH5Q12175 DTR1YBR180W 1719 nt8.83□□□□□ -1
MSH5Q12175 SBA1YKL117W 651 nt8.82□□□□□ -1
MSH5Q12175 YML089CYML089C 369 nt8.82□□□□□ -1
MSH5Q12175 RTG1YOL067C 534 nt8.82□□□□□ -1
MSH5Q12175 VPS62YGR141W 1404 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 MDL2YPL270W 2322 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 SAM1YLR180W 1149 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 PHO23YNL097C 993 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.81□□□□□ -1
MSH5Q12175 SED1YDR077W 1017 nt8.8□□□□□ -1
MSH5Q12175 YDL086WYDL086W 822 nt8.79□□□□□ -1
MSH5Q12175 MTO1YGL236C 2010 nt8.79□□□□□ -1
MSH5Q12175 LEU9YOR108W 1815 nt8.79□□□□□ -1
MSH5Q12175 FMS1YMR020W 1527 nt8.79□□□□□ -1
MSH5Q12175 NBA1YOL070C 1506 nt8.79□□□□□ -1
MSH5Q12175 TOA2YKL058W 369 nt8.77□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 VPS75YNL246W 795 nt8.75□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 PEX25YPL112C 1185 nt8.75□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 BRR1YPR057W 1026 nt8.74□□□□□ -1.01
MSH5Q12175 GND2YGR256W 1479 nt8.73□□□□□ -1.01
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