Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 PAU15YIR041W 375 nt12.94□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 RIB3YDR487C 627 nt12.93□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 TIR3YIL011W 810 nt12.93□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 FUN14YAL008W 597 nt12.93□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 TSC10YBR265W 963 nt12.93□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 CCA1YER168C 1641 nt12.92□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 NBP35YGL091C 987 nt12.92□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 YJL195CYJL195C 702 nt12.9□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 HIP1YGR191W 1812 nt12.9□□□□□ -0.34
SLM3Q12093 NRT1YOR071C 1797 nt12.89□□□□□ -0.35
SLM3Q12093 POM34YLR018C 900 nt12.85□□□□□ -0.35
SLM3Q12093 GPN2YOR262W 1044 nt12.81□□□□□ -0.36
SLM3Q12093 ADH1YOL086C 1047 nt12.8□□□□□ -0.36
SLM3Q12093 PRO1YDR300C 1287 nt12.79□□□□□ -0.36
SLM3Q12093 MSB4YOL112W 1479 nt12.77□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 MET28YIR017C 564 nt12.76□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 AQY2YLL052C 450 nt12.76□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 DUS1YML080W 1272 nt12.76□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 YML089CYML089C 369 nt12.76□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.75□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 TIF6YPR016C 738 nt12.75□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 ATG15YCR068W 1563 nt12.73□□□□□ -0.37
SLM3Q12093 STR3YGL184C 1398 nt12.7□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 LSC2YGR244C 1284 nt12.69□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 YPI1YFR003C 468 nt12.68□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 SWE1YJL187C 2460 nt12.67□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 YEL008WYEL008W 381 nt12.67□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 CPD1YGR247W 720 nt12.66□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.65□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.65□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.65□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 AAC1YMR056C 930 nt12.65□□□□□ -0.38
SLM3Q12093 ESS1YJR017C 513 nt12.64□□□□□ -0.39
SLM3Q12093 LOT5YKL183W 921 nt12.64□□□□□ -0.39
SLM3Q12093 FIT3YOR383C 615 nt12.62□□□□□ -0.39
SLM3Q12093 GND1YHR183W 1470 nt12.6□□□□□ -0.39
SLM3Q12093 APT2YDR441C 546 nt12.56□□□□□ -0.4
SLM3Q12093 YCL074WYCL074W 927 nt12.53□□□□□ -0.4
SLM3Q12093 GAP1YKR039W 1809 nt12.52□□□□□ -0.41
SLM3Q12093 ARP6YLR085C 1317 nt12.51□□□□□ -0.41
SLM3Q12093 SMM1YNR015W 1155 nt12.47□□□□□ -0.41
SLM3Q12093 SEN2YLR105C 1134 nt12.46□□□□□ -0.41
SLM3Q12093 ZTA1YBR046C 1005 nt12.46□□□□□ -0.41
SLM3Q12093 RIB2YOL066C 1776 nt12.43□□□□□ -0.42
SLM3Q12093 PUP1YOR157C 786 nt12.43□□□□□ -0.42
SLM3Q12093 ALP1YNL270C 1722 nt12.4□□□□□ -0.42
SLM3Q12093 NAP1YKR048C 1254 nt12.4□□□□□ -0.42
SLM3Q12093 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.4□□□□□ -0.42
SLM3Q12093 PLB1YMR008C 1995 nt12.39□□□□□ -0.43
SLM3Q12093 AKR2YOR034C 2250 nt12.39□□□□□ -0.43
SLM3Q12093 YAR028WYAR028W 705 nt12.38□□□□□ -0.43
SLM3Q12093 DIF1YLR437C 402 nt12.36□□□□□ -0.43
SLM3Q12093 MTG2YHR168W 1557 nt12.35□□□□□ -0.43
SLM3Q12093 PAU5YFL020C 369 nt12.33□□□□□ -0.44
SLM3Q12093 FCY21YER060W 1587 nt12.32□□□□□ -0.44
SLM3Q12093 RTN2YDL204W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
SLM3Q12093 PGC1YPL206C 966 nt12.32□□□□□ -0.44
SLM3Q12093 VRG4YGL225W 1014 nt12.26□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 PRY1YJL079C 900 nt12.26□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 ALD4YOR374W 1560 nt12.26□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 YBR232CYBR232C 360 nt12.25□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 UTR1YJR049C 1593 nt12.25□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 HXT12YIL170W 1374 nt12.24□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 YJL064WYJL064W 396 nt12.22□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 UGA4YDL210W 1716 nt12.22□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 FUR4YBR021W 1902 nt12.21□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 YJL055WYJL055W 738 nt12.21□□□□□ -0.45
SLM3Q12093 STP3YLR375W 1032 nt12.19□□□□□ -0.46
SLM3Q12093 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.17□□□□□ -0.46
SLM3Q12093 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.17□□□□□ -0.46
SLM3Q12093 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.17□□□□□ -0.46
SLM3Q12093 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.17□□□□□ -0.46
SLM3Q12093 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.17□□□□□ -0.46
SLM3Q12093 PAU19YMR325W 375 nt12.14□□□□□ -0.47
SLM3Q12093 CCT5YJR064W 1689 nt12.12□□□□□ -0.47
SLM3Q12093 SLG1YOR008C 1137 nt12.11□□□□□ -0.47
SLM3Q12093 SED1YDR077W 1017 nt12.1□□□□□ -0.47
SLM3Q12093 YJR114WYJR114W 393 nt12.07□□□□□ -0.48
SLM3Q12093 YGR259CYGR259C 441 nt12.06□□□□□ -0.48
SLM3Q12093 TIM44YIL022W 1296 nt12.06□□□□□ -0.48
SLM3Q12093 THI72YOR192C 1800 nt12.02□□□□□ -0.48
SLM3Q12093 YKR005CYKR005C 1578 nt12.02□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 LIP1YMR298W 453 nt12.02□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 HSP60YLR259C 1719 nt12.01□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 SAM35YHR083W 990 nt12.01□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 PRM5YIL117C 957 nt12.01□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 TAF13YML098W 504 nt12□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 CSM1YCR086W 573 nt11.99□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 YPL251WYPL251W 303 nt11.99□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 TIP1YBR067C 633 nt11.98□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 MEP3YPR138C 1470 nt11.96□□□□□ -0.49
SLM3Q12093 YMR103CYMR103C 363 nt11.95□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 GAL3YDR009W 1563 nt11.94□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 YJL118WYJL118W 660 nt11.94□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 YMR262WYMR262W 942 nt11.94□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 LSB5YCL034W 1065 nt11.94□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 RIB1YBL033C 1038 nt11.92□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 BRR1YPR057W 1026 nt11.91□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 ERG6YML008C 1152 nt11.9□□□□□ -0.5
SLM3Q12093 SNZ1YMR096W 894 nt11.9□□□□□ -0.5
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