Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYBPC1Q00872 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYBPC1Q00872 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYBPC1Q00872 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYBPC1Q00872 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYBPC1Q00872 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYBPC1Q00872 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYBPC1Q00872 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYBPC1Q00872 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYBPC1Q00872 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYBPC1Q00872 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYBPC1Q00872 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYBPC1Q00872 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYBPC1Q00872 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms