Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CBX1P83916 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CBX1P83916 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CBX1P83916 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBX1P83916 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBX1P83916 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CBX1P83916 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBX1P83916 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CBX1P83916 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CBX1P83916 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CBX1P83916 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CBX1P83916 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CBX1P83916 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CBX1P83916 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBX1P83916 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBX1P83916 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBX1P83916 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX1P83916 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX1P83916 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX1P83916 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBX1P83916 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX1P83916 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CBX1P83916 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CBX1P83916 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CBX1P83916 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CBX1P83916 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CBX1P83916 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX1P83916 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX1P83916 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CBX1P83916 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX1P83916 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX1P83916 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX1P83916 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX1P83916 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CBX1P83916 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBX1P83916 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBX1P83916 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBX1P83916 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX1P83916 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CBX1P83916 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CBX1P83916 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CBX1P83916 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX1P83916 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CBX1P83916 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX1P83916 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX1P83916 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CBX1P83916 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX1P83916 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBX1P83916 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CBX1P83916 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX1P83916 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX1P83916 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CBX1P83916 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CBX1P83916 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX1P83916 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CBX1P83916 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBX1P83916 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBX1P83916 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CBX1P83916 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CBX1P83916 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX1P83916 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX1P83916 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX1P83916 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CBX1P83916 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX1P83916 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX1P83916 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CBX1P83916 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBX1P83916 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CBX1P83916 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CBX1P83916 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX1P83916 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX1P83916 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CBX1P83916 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX1P83916 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX1P83916 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CBX1P83916 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBX1P83916 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CBX1P83916 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX1P83916 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX1P83916 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CBX1P83916 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX1P83916 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX1P83916 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX1P83916 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CBX1P83916 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBX1P83916 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CBX1P83916 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBX1P83916 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CBX1P83916 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBX1P83916 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX1P83916 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CBX1P83916 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX1P83916 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX1P83916 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBX1P83916 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX1P83916 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX1P83916 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CBX1P83916 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBX1P83916 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CBX1P83916 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms