Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABARAPL2P60520 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABARAPL2P60520 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABARAPL2P60520 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABARAPL2P60520 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABARAPL2P60520 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABARAPL2P60520 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABARAPL2P60520 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPL2P60520 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms