Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 YGR259CYGR259C 441 nt6.86□□□□□ -1.31
GIS2P53849 SGT2YOR007C 1041 nt6.86□□□□□ -1.31 RIP-Chip
GIS2P53849 SNF1YDR477W 1902 nt6.86□□□□□ -1.31
GIS2P53849 RDN18-1RDN18-1 1800 nt6.85□□□□□ -1.31
GIS2P53849 RDN18-2RDN18-2 1800 nt6.85□□□□□ -1.31
GIS2P53849 STR3YGL184C 1398 nt6.84□□□□□ -1.31
GIS2P53849 PAU15YIR041W 375 nt6.84□□□□□ -1.31
GIS2P53849 FUN14YAL008W 597 nt6.84□□□□□ -1.31
GIS2P53849 BIO5YNR056C 1686 nt6.83□□□□□ -1.32
GIS2P53849 RPL4BYDR012W 1089 nt6.82□□□□□ -1.32
GIS2P53849 NIT1YIL164C 600 nt6.82□□□□□ -1.32
GIS2P53849 SDH5YOL071W 489 nt6.82□□□□□ -1.32 RIP-Chip
GIS2P53849 RPL4AYBR031W 1089 nt6.82□□□□□ -1.32
GIS2P53849 GDH3YAL062W 1374 nt6.82□□□□□ -1.32
GIS2P53849 CLB6YGR109C 1143 nt6.81□□□□□ -1.32
GIS2P53849 GOR1YNL274C 1053 nt6.81□□□□□ -1.32
GIS2P53849 COQ2YNR041C 1119 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
GIS2P53849 AVT6YER119C 1347 nt6.8□□□□□ -1.32
GIS2P53849 IRC24YIR036C 792 nt6.8□□□□□ -1.32
GIS2P53849 NAR1YNL240C 1476 nt6.79□□□□□ -1.32
GIS2P53849 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt6.78□□□□□ -1.32
GIS2P53849 YJL195CYJL195C 702 nt6.77□□□□□ -1.33
GIS2P53849 AQY2YLL052C 450 nt6.77□□□□□ -1.33
GIS2P53849 PBP1YGR178C 2169 nt6.76□□□□□ -1.33
GIS2P53849 RIB3YDR487C 627 nt6.75□□□□□ -1.33 RIP-Chip
GIS2P53849 ESS1YJR017C 513 nt6.75□□□□□ -1.33
GIS2P53849 NAP1YKR048C 1254 nt6.75□□□□□ -1.33 RIP-Chip
GIS2P53849 RPS14BYJL191W 417 nt6.74□□□□□ -1.33
GIS2P53849 YLR279WYLR279W 390 nt6.73□□□□□ -1.33
GIS2P53849 TSC10YBR265W 963 nt6.73□□□□□ -1.33
GIS2P53849 UTH1YKR042W 1098 nt6.72□□□□□ -1.33 RIP-Chip
GIS2P53849 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.71□□□□□ -1.34
GIS2P53849 NME1NME1 340 nt6.71□□□□□ -1.34
GIS2P53849 CPD1YGR247W 720 nt6.7□□□□□ -1.34
GIS2P53849 SFA1YDL168W 1161 nt6.69□□□□□ -1.34
GIS2P53849 RTN2YDL204W 1182 nt6.69□□□□□ -1.34
GIS2P53849 YEL008WYEL008W 381 nt6.69□□□□□ -1.34
GIS2P53849 CYT2YKL087C 675 nt6.69□□□□□ -1.34 RIP-Chip
GIS2P53849 YCR102CYCR102C 1107 nt6.68□□□□□ -1.34
GIS2P53849 YGR012WYGR012W 1182 nt6.68□□□□□ -1.34
GIS2P53849 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt6.68□□□□□ -1.34
GIS2P53849 YPI1YFR003C 468 nt6.66□□□□□ -1.34 RIP-Chip
GIS2P53849 ADH1YOL086C 1047 nt6.66□□□□□ -1.34
GIS2P53849 GPN2YOR262W 1044 nt6.66□□□□□ -1.34
GIS2P53849 NBP35YGL091C 987 nt6.65□□□□□ -1.34
GIS2P53849 SEN2YLR105C 1134 nt6.64□□□□□ -1.35 RIP-Chip
GIS2P53849 PUP1YOR157C 786 nt6.64□□□□□ -1.35
GIS2P53849 PLB1YMR008C 1995 nt6.63□□□□□ -1.35
GIS2P53849 CAB5YDR196C 726 nt6.61□□□□□ -1.35 RIP-Chip
GIS2P53849 ARP6YLR085C 1317 nt6.6□□□□□ -1.35
GIS2P53849 NRT1YOR071C 1797 nt6.59□□□□□ -1.35 RIP-Chip
GIS2P53849 TIR3YIL011W 810 nt6.58□□□□□ -1.36
GIS2P53849 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt6.58□□□□□ -1.36
GIS2P53849 HIP1YGR191W 1812 nt6.57□□□□□ -1.36 RIP-Chip
GIS2P53849 YML089CYML089C 369 nt6.57□□□□□ -1.36
GIS2P53849 YAT1YAR035W 2064 nt6.56□□□□□ -1.36
GIS2P53849 TIM44YIL022W 1296 nt6.55□□□□□ -1.36 RIP-Chip
GIS2P53849 MET28YIR017C 564 nt6.55□□□□□ -1.36
GIS2P53849 YJR114WYJR114W 393 nt6.55□□□□□ -1.36
GIS2P53849 FIT3YOR383C 615 nt6.55□□□□□ -1.36
GIS2P53849 PRM5YIL117C 957 nt6.54□□□□□ -1.36
GIS2P53849 HIF1YLL022C 1158 nt6.54□□□□□ -1.36
GIS2P53849 CMP2YML057W 1815 nt6.53□□□□□ -1.36
GIS2P53849 ALD4YOR374W 1560 nt6.52□□□□□ -1.36
GIS2P53849 PEX2YJL210W 816 nt6.52□□□□□ -1.37 RIP-Chip
GIS2P53849 TOM6YOR045W 186 nt6.52□□□□□ -1.37 RIP-Chip
GIS2P53849 GND1YHR183W 1470 nt6.52□□□□□ -1.37
GIS2P53849 UTR1YJR049C 1593 nt6.52□□□□□ -1.37
GIS2P53849 LOT5YKL183W 921 nt6.51□□□□□ -1.37
GIS2P53849 MSB4YOL112W 1479 nt6.5□□□□□ -1.37 RIP-Chip
GIS2P53849 LSC2YGR244C 1284 nt6.5□□□□□ -1.37
GIS2P53849 SHH4YLR164W 507 nt6.5□□□□□ -1.37
GIS2P53849 GAP1YKR039W 1809 nt6.5□□□□□ -1.37
GIS2P53849 POM34YLR018C 900 nt6.49□□□□□ -1.37
GIS2P53849 YBR232CYBR232C 360 nt6.49□□□□□ -1.37
GIS2P53849 PRO1YDR300C 1287 nt6.48□□□□□ -1.37
GIS2P53849 STP3YLR375W 1032 nt6.48□□□□□ -1.37
GIS2P53849 RIB1YBL033C 1038 nt6.48□□□□□ -1.37 RIP-Chip
GIS2P53849 PGC1YPL206C 966 nt6.47□□□□□ -1.37
GIS2P53849 TIF6YPR016C 738 nt6.47□□□□□ -1.37
GIS2P53849 PAU19YMR325W 375 nt6.46□□□□□ -1.38
GIS2P53849 YJL064WYJL064W 396 nt6.45□□□□□ -1.38
GIS2P53849 PAU5YFL020C 369 nt6.43□□□□□ -1.38
GIS2P53849 SAM35YHR083W 990 nt6.43□□□□□ -1.38 RIP-Chip
GIS2P53849 RPC82YPR190C 1965 nt6.43□□□□□ -1.38
GIS2P53849 INA1YLR413W 2028 nt6.42□□□□□ -1.38
GIS2P53849 SPT20YOL148C 1815 nt6.42□□□□□ -1.38
GIS2P53849 ATG15YCR068W 1563 nt6.42□□□□□ -1.38
GIS2P53849 LSB3YFR024C-A 1380 nt6.41□□□□□ -1.38 RIP-Chip
GIS2P53849 ZRT3YKL175W 1512 nt6.4□□□□□ -1.38 RIP-Chip
GIS2P53849 HSL7YBR133C 2484 nt6.4□□□□□ -1.38
GIS2P53849 APT2YDR441C 546 nt6.39□□□□□ -1.39
GIS2P53849 YIA6YIL006W 1122 nt6.38□□□□□ -1.39
GIS2P53849 CSM2YIL132C 642 nt6.38□□□□□ -1.39
GIS2P53849 DIF1YLR437C 402 nt6.38□□□□□ -1.39
GIS2P53849 SLG1YOR008C 1137 nt6.38□□□□□ -1.39
GIS2P53849 RDN25-1RDN25-1 3396 nt6.38□□□□□ -1.39
GIS2P53849 RDN25-2RDN25-2 3396 nt6.38□□□□□ -1.39
GIS2P53849 DBP1YPL119C 1854 nt6.36□□□□□ -1.39
GIS2P53849 SOD2YHR008C 702 nt6.36□□□□□ -1.39
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