Protein–RNA interactions for Protein: P53104

ATG1, Serine/threonine-protein kinase ATG1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG1P53104 AVT6YER119C 1347 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG1P53104 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG1P53104 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG1P53104 RIB3YDR487C 627 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG1P53104 YJL195CYJL195C 702 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG1P53104 UTH1YKR042W 1098 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG1P53104 YJL225CYJL225C 5277 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG1P53104 RAX1YOR301W 1308 nt11.25□□□□□ -0.61
ATG1P53104 CCA1YER168C 1641 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG1P53104 BOR1YNL275W 1731 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG1P53104 TSC10YBR265W 963 nt11.24□□□□□ -0.61
ATG1P53104 GOR1YNL274C 1053 nt11.22□□□□□ -0.61
ATG1P53104 YGR012WYGR012W 1182 nt11.21□□□□□ -0.61
ATG1P53104 YLR279WYLR279W 390 nt11.21□□□□□ -0.61
ATG1P53104 HSP60YLR259C 1719 nt11.21□□□□□ -0.62
ATG1P53104 CAB5YDR196C 726 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG1P53104 PAU21YOR394W 495 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG1P53104 PAU22YPL282C 495 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG1P53104 FUR4YBR021W 1902 nt11.15□□□□□ -0.62
ATG1P53104 ESS1YJR017C 513 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG1P53104 ADH1YOL086C 1047 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG1P53104 TIR3YIL011W 810 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG1P53104 AGP1YCL025C 1902 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG1P53104 HIP1YGR191W 1812 nt11.1□□□□□ -0.63
ATG1P53104 YEL008WYEL008W 381 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG1P53104 YJR154WYJR154W 1041 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG1P53104 NRT1YOR071C 1797 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG1P53104 YPI1YFR003C 468 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG1P53104 CPD1YGR247W 720 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG1P53104 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG1P53104 GPN2YOR262W 1044 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG1P53104 Q0010Q0010 387 nt11.07□□□□□ -0.64
ATG1P53104 SHH4YLR164W 507 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG1P53104 TOM6YOR045W 186 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG1P53104 ARO7YPR060C 771 nt11.05□□□□□ -0.64
ATG1P53104 NAP1YKR048C 1254 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG1P53104 YML089CYML089C 369 nt11.04□□□□□ -0.64
ATG1P53104 PEX2YJL210W 816 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG1P53104 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG1P53104 NBP35YGL091C 987 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG1P53104 MET28YIR017C 564 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG1P53104 POM34YLR018C 900 nt10.99□□□□□ -0.65
ATG1P53104 DUT1YBR252W 444 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG1P53104 FIT3YOR383C 615 nt10.96□□□□□ -0.65
ATG1P53104 MSB4YOL112W 1479 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG1P53104 LSC2YGR244C 1284 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG1P53104 SEN2YLR105C 1134 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG1P53104 PUP1YOR157C 786 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG1P53104 TIF6YPR016C 738 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG1P53104 PRP4YPR178W 1398 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG1P53104 GND1YHR183W 1470 nt10.92□□□□□ -0.66
ATG1P53104 LOT5YKL183W 921 nt10.91□□□□□ -0.66
ATG1P53104 ALG12YNR030W 1656 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG1P53104 PRO1YDR300C 1287 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG1P53104 DUS1YML080W 1272 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG1P53104 DPS1YLL018C 1674 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG1P53104 YCL074WYCL074W 927 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG1P53104 AAC1YMR056C 930 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG1P53104 ATG15YCR068W 1563 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG1P53104 YKR005CYKR005C 1578 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG1P53104 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG1P53104 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.85□□□□□ -0.67
ATG1P53104 MCH5YOR306C 1566 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG1P53104 SNF1YDR477W 1902 nt10.8□□□□□ -0.68
ATG1P53104 STR3YGL184C 1398 nt10.8□□□□□ -0.68
ATG1P53104 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG1P53104 YBR232CYBR232C 360 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG1P53104 APT2YDR441C 546 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG1P53104 YGR259CYGR259C 441 nt10.76□□□□□ -0.69
ATG1P53104 PGC1YPL206C 966 nt10.75□□□□□ -0.69
ATG1P53104 PAB1YER165W 1734 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG1P53104 TIM44YIL022W 1296 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG1P53104 AQY2YLL052C 450 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG1P53104 STP3YLR375W 1032 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG1P53104 BIO5YNR056C 1686 nt10.73□□□□□ -0.69
ATG1P53104 YJR114WYJR114W 393 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG1P53104 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG1P53104 BMT6YLR063W 1098 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG1P53104 PAU5YFL020C 369 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG1P53104 SMM1YNR015W 1155 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG1P53104 ARP6YLR085C 1317 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG1P53104 YJL064WYJL064W 396 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG1P53104 ALP1YNL270C 1722 nt10.69□□□□□ -0.7
ATG1P53104 PAU19YMR325W 375 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG1P53104 GAP1YKR039W 1809 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG1P53104 RIB2YOL066C 1776 nt10.67□□□□□ -0.7
ATG1P53104 FCY21YER060W 1587 nt10.65□□□□□ -0.71
ATG1P53104 IRC24YIR036C 792 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG1P53104 YAR028WYAR028W 705 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG1P53104 HXT12YIL170W 1374 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG1P53104 RIB1YBL033C 1038 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG1P53104 PBP1YGR178C 2169 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG1P53104 NAR1YNL240C 1476 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG1P53104 BSP1YPR171W 1731 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG1P53104 SLG1YOR008C 1137 nt10.57□□□□□ -0.72
ATG1P53104 ALD4YOR374W 1560 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG1P53104 ZTA1YBR046C 1005 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG1P53104 AKR2YOR034C 2250 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG1P53104 MTG2YHR168W 1557 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG1P53104 RTN2YDL204W 1182 nt10.55□□□□□ -0.72
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