Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 SGT2YOR007C 1041 nt9.31□□□□□ -0.92
MDE1P47095 NIT1YIL164C 600 nt9.3□□□□□ -0.92
MDE1P47095 PAU7YAR020C 168 nt9.3□□□□□ -0.92
MDE1P47095 RRT5YFR032C 870 nt9.28□□□□□ -0.92
MDE1P47095 YFL066CYFL066C 1179 nt9.27□□□□□ -0.93
MDE1P47095 MCM5YLR274W 2328 nt9.26□□□□□ -0.93
MDE1P47095 MUP1YGR055W 1725 nt9.25□□□□□ -0.93
MDE1P47095 YDR094WYDR094W 336 nt9.24□□□□□ -0.93
MDE1P47095 DTR1YBR180W 1719 nt9.23□□□□□ -0.93
MDE1P47095 TPO4YOR273C 1980 nt9.23□□□□□ -0.93
MDE1P47095 ACO2YJL200C 2370 nt9.21□□□□□ -0.93
MDE1P47095 NBP35YGL091C 987 nt9.2□□□□□ -0.94
MDE1P47095 INA1YLR413W 2028 nt9.19□□□□□ -0.94
MDE1P47095 HEM14YER014W 1620 nt9.19□□□□□ -0.94
MDE1P47095 UGA4YDL210W 1716 nt9.17□□□□□ -0.94
MDE1P47095 PRE6YOL038W 765 nt9.16□□□□□ -0.94
MDE1P47095 ARP6YLR085C 1317 nt9.14□□□□□ -0.95
MDE1P47095 ILV2YMR108W 2064 nt9.13□□□□□ -0.95
MDE1P47095 LSC2YGR244C 1284 nt9.13□□□□□ -0.95
MDE1P47095 TIR3YIL011W 810 nt9.13□□□□□ -0.95
MDE1P47095 HOL1YNR055C 1761 nt9.11□□□□□ -0.95
MDE1P47095 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.1□□□□□ -0.95
MDE1P47095 PLB1YMR008C 1995 nt9.1□□□□□ -0.95
MDE1P47095 SHB17YKR043C 816 nt9.09□□□□□ -0.95
MDE1P47095 SAM35YHR083W 990 nt9.08□□□□□ -0.96
MDE1P47095 PAU16YKL224C 372 nt9.08□□□□□ -0.96
MDE1P47095 MIR1YJR077C 936 nt9.07□□□□□ -0.96
MDE1P47095 MAS1YLR163C 1389 nt9.07□□□□□ -0.96
MDE1P47095 YML089CYML089C 369 nt9.06□□□□□ -0.96
MDE1P47095 NAT4YMR069W 858 nt9.05□□□□□ -0.96
MDE1P47095 THI74YDR438W 1113 nt9.04□□□□□ -0.96
MDE1P47095 URA8YJR103W 1737 nt9.04□□□□□ -0.96
MDE1P47095 RET2YFR051C 1641 nt9.04□□□□□ -0.96
MDE1P47095 GAP1YKR039W 1809 nt9.03□□□□□ -0.96
MDE1P47095 YDR010CYDR010C 333 nt9.03□□□□□ -0.96
MDE1P47095 UBA4YHR111W 1323 nt9.03□□□□□ -0.96
MDE1P47095 YCR087WYCR087W 516 nt9.02□□□□□ -0.97
MDE1P47095 ATG15YCR068W 1563 nt9.01□□□□□ -0.97
MDE1P47095 PRO1YDR300C 1287 nt9.01□□□□□ -0.97
MDE1P47095 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.01□□□□□ -0.97
MDE1P47095 YSR3YKR053C 1215 nt9.01□□□□□ -0.97
MDE1P47095 PHO89YBR296C 1725 nt9.01□□□□□ -0.97
MDE1P47095 POM34YLR018C 900 nt8.99□□□□□ -0.97
MDE1P47095 ALD4YOR374W 1560 nt8.99□□□□□ -0.97
MDE1P47095 MRP20YDR405W 792 nt8.97□□□□□ -0.97
MDE1P47095 SHH4YLR164W 507 nt8.97□□□□□ -0.97
MDE1P47095 RSC4YKR008W 1878 nt8.97□□□□□ -0.97
MDE1P47095 MSF1YPR047W 1410 nt8.96□□□□□ -0.98
MDE1P47095 UTR1YJR049C 1593 nt8.95□□□□□ -0.98
MDE1P47095 PRM5YIL117C 957 nt8.95□□□□□ -0.98
MDE1P47095 YMR209CYMR209C 1374 nt8.95□□□□□ -0.98
MDE1P47095 SFA1YDL168W 1161 nt8.94□□□□□ -0.98
MDE1P47095 YHL008CYHL008C 1884 nt8.92□□□□□ -0.98
MDE1P47095 CLB6YGR109C 1143 nt8.92□□□□□ -0.98
MDE1P47095 HIF1YLL022C 1158 nt8.92□□□□□ -0.98
MDE1P47095 TOM6YOR045W 186 nt8.92□□□□□ -0.98
MDE1P47095 GTB1YDR221W 2109 nt8.91□□□□□ -0.98
MDE1P47095 YGL034CYGL034C 366 nt8.87□□□□□ -0.99
MDE1P47095 PEX2YJL210W 816 nt8.87□□□□□ -0.99
MDE1P47095 RPL4BYDR012W 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 MET28YIR017C 564 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 UTH1YKR042W 1098 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 XYL2YLR070C 1071 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 COQ2YNR041C 1119 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 RPL4AYBR031W 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 AIM45YPR004C 1035 nt8.86□□□□□ -0.99
MDE1P47095 DIF1YLR437C 402 nt8.85□□□□□ -0.99
MDE1P47095 TOK1YJL093C 2076 nt8.85□□□□□ -0.99
MDE1P47095 TIF6YPR016C 738 nt8.84□□□□□ -0.99
MDE1P47095 HIP1YGR191W 1812 nt8.84□□□□□ -0.99
MDE1P47095 NRT1YOR071C 1797 nt8.83□□□□□ -1
MDE1P47095 ZRT3YKL175W 1512 nt8.81□□□□□ -1
MDE1P47095 YAR028WYAR028W 705 nt8.81□□□□□ -1
MDE1P47095 FIT3YOR383C 615 nt8.8□□□□□ -1
MDE1P47095 HXT1YHR094C 1713 nt8.79□□□□□ -1
MDE1P47095 UGP1YKL035W 1500 nt8.79□□□□□ -1
MDE1P47095 GAL2YLR081W 1725 nt8.77□□□□□ -1
MDE1P47095 SED1YDR077W 1017 nt8.76□□□□□ -1.01
MDE1P47095 RBG1YAL036C 1110 nt8.76□□□□□ -1.01
MDE1P47095 YDR306CYDR306C 1437 nt8.76□□□□□ -1.01
MDE1P47095 THI72YOR192C 1800 nt8.75□□□□□ -1.01
MDE1P47095 YNL024CYNL024C 741 nt8.75□□□□□ -1.01
MDE1P47095 GNP1YDR508C 1992 nt8.74□□□□□ -1.01
MDE1P47095 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.74□□□□□ -1.01
MDE1P47095 RPS14BYJL191W 417 nt8.74□□□□□ -1.01
MDE1P47095 LIP1YMR298W 453 nt8.74□□□□□ -1.01
MDE1P47095 ILV3YJR016C 1758 nt8.73□□□□□ -1.01
MDE1P47095 ALP1YNL270C 1722 nt8.73□□□□□ -1.01
MDE1P47095 PSD1YNL169C 1503 nt8.72□□□□□ -1.01
MDE1P47095 DBP1YPL119C 1854 nt8.72□□□□□ -1.01
MDE1P47095 HIS2YFR025C 1008 nt8.71□□□□□ -1.02
MDE1P47095 YOR325WYOR325W 474 nt8.71□□□□□ -1.02
MDE1P47095 AKR2YOR034C 2250 nt8.71□□□□□ -1.02
MDE1P47095 HXK1YFR053C 1458 nt8.7□□□□□ -1.02
MDE1P47095 PUS7YOR243C 2031 nt8.7□□□□□ -1.02
MDE1P47095 ALD5YER073W 1563 nt8.69□□□□□ -1.02
MDE1P47095 YJL067WYJL067W 351 nt8.69□□□□□ -1.02
MDE1P47095 SAM1YLR180W 1149 nt8.69□□□□□ -1.02
MDE1P47095 TSC10YBR265W 963 nt8.69□□□□□ -1.02
MDE1P47095 COQ8YGL119W 1506 nt8.69□□□□□ -1.02
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