Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAP2K4P45985 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAP2K4P45985 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAP2K4P45985 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAP2K4P45985 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP2K4P45985 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP2K4P45985 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP2K4P45985 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP2K4P45985 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP2K4P45985 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms