Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 VPS75YNL246W 795 nt7.58□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 MET2YNL277W 1461 nt7.57□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 PEX25YPL112C 1185 nt7.57□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 NPP1YCR026C 2229 nt7.56□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 ESBP6YNL125C 2022 nt7.56□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 SFP1YLR403W 2052 nt7.54□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 UBX6YJL048C 1191 nt7.53□□□□□ -1.2
YHR140WP38842 RIM8YGL045W 1629 nt7.52□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 PRO1YDR300C 1287 nt7.51□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 YML089CYML089C 369 nt7.5□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 MAE1YKL029C 2010 nt7.49□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 POM34YLR018C 900 nt7.49□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 ADO1YJR105W 1023 nt7.48□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 ATG15YCR068W 1563 nt7.47□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 MRPL8YJL063C 717 nt7.47□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 SHH4YLR164W 507 nt7.47□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 YGL114WYGL114W 2178 nt7.46□□□□□ -1.21
YHR140WP38842 PAU7YAR020C 168 nt7.46□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 YFL066CYFL066C 1179 nt7.45□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 YJL067WYJL067W 351 nt7.45□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 DIF1YLR437C 402 nt7.44□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 HXT1YHR094C 1713 nt7.44□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 ILV2YMR108W 2064 nt7.43□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 DBP1YPL119C 1854 nt7.43□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 PRE6YOL038W 765 nt7.43□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 DTR1YBR180W 1719 nt7.41□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 YFR018CYFR018C 1092 nt7.4□□□□□ -1.22
YHR140WP38842 YDR010CYDR010C 333 nt7.38□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 SHY1YGR112W 1170 nt7.38□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.38□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 RFC1YOR217W 2586 nt7.38□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 MUP1YGR055W 1725 nt7.38□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 SFA1YDL168W 1161 nt7.37□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 TOM6YOR045W 186 nt7.37□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 ILV3YJR016C 1758 nt7.36□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 HMG2YLR450W 3138 nt7.36□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 HOL1YNR055C 1761 nt7.36□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 SHB17YKR043C 816 nt7.35□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 RET2YFR051C 1641 nt7.34□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 LIP1YMR298W 453 nt7.34□□□□□ -1.23
YHR140WP38842 TPO4YOR273C 1980 nt7.33□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 YAR028WYAR028W 705 nt7.33□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 TIF6YPR016C 738 nt7.33□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 ACO2YJL200C 2370 nt7.33□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 SED1YDR077W 1017 nt7.32□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.32□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 URA6YKL024C 615 nt7.32□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 YNL024CYNL024C 741 nt7.32□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 UGA4YDL210W 1716 nt7.31□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 YBL086CYBL086C 1401 nt7.31□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 MET28YIR017C 564 nt7.29□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 PEX2YJL210W 816 nt7.29□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 HIP1YGR191W 1812 nt7.29□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 CWC15YDR163W 528 nt7.28□□□□□ -1.24
YHR140WP38842 PHO89YBR296C 1725 nt7.27□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 GTB1YDR221W 2109 nt7.27□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 MRP20YDR405W 792 nt7.27□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 OPI10YOL032W 741 nt7.27□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YOR325WYOR325W 474 nt7.27□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 HEM14YER014W 1620 nt7.27□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 HIS2YFR025C 1008 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 MIR1YJR077C 936 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 SAM1YLR180W 1149 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 LEU9YOR108W 1815 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 UBA4YHR111W 1323 nt7.26□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 RRT5YFR032C 870 nt7.25□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 MTG2YHR168W 1557 nt7.25□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 PET8YNL003C 855 nt7.24□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 UFO1YML088W 2007 nt7.23□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 YCR087WYCR087W 516 nt7.23□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 COQ8YGL119W 1506 nt7.22□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 GAL2YLR081W 1725 nt7.22□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 ALP1YNL270C 1722 nt7.22□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 FIT3YOR383C 615 nt7.22□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 OYE3YPL171C 1203 nt7.22□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 CCT2YIL142W 1584 nt7.21□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 NRT1YOR071C 1797 nt7.21□□□□□ -1.25
YHR140WP38842 CLB6YGR109C 1143 nt7.21□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 TOA2YKL058W 369 nt7.21□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 YSR3YKR053C 1215 nt7.21□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 COQ2YNR041C 1119 nt7.21□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 BRR1YPR057W 1026 nt7.21□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 UTH1YKR042W 1098 nt7.2□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 AKR2YOR034C 2250 nt7.2□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 ARO8YGL202W 1503 nt7.19□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 URA8YJR103W 1737 nt7.18□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 RPL4BYDR012W 1089 nt7.18□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 THI74YDR438W 1113 nt7.18□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 RPL4AYBR031W 1089 nt7.18□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 TOK1YJL093C 2076 nt7.17□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.17□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 YPL251WYPL251W 303 nt7.17□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 UGP1YKL035W 1500 nt7.17□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 KES1YPL145C 1305 nt7.16□□□□□ -1.26
YHR140WP38842 GND2YGR256W 1479 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms