Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 YMR226CYMR226C 804 nt11□□□□□ -0.65
UBP11P36026 HIP1YGR191W 1812 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP11P36026 CAB5YDR196C 726 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP11P36026 CLB6YGR109C 1143 nt10.96□□□□□ -0.65
UBP11P36026 SDH5YOL071W 489 nt10.96□□□□□ -0.65
UBP11P36026 YLR111WYLR111W 333 nt10.95□□□□□ -0.66
UBP11P36026 LSC2YGR244C 1284 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP11P36026 UTH1YKR042W 1098 nt10.94□□□□□ -0.66
UBP11P36026 TIF6YPR016C 738 nt10.93□□□□□ -0.66
UBP11P36026 ARP6YLR085C 1317 nt10.92□□□□□ -0.66
UBP11P36026 ATG15YCR068W 1563 nt10.92□□□□□ -0.66
UBP11P36026 NRT1YOR071C 1797 nt10.92□□□□□ -0.66
UBP11P36026 YML089CYML089C 369 nt10.91□□□□□ -0.66
UBP11P36026 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.88□□□□□ -0.67
UBP11P36026 YGR012WYGR012W 1182 nt10.87□□□□□ -0.67
UBP11P36026 SAM1YLR180W 1149 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP11P36026 PLB1YMR008C 1995 nt10.86□□□□□ -0.67
UBP11P36026 RAD23YEL037C 1197 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP11P36026 MET28YIR017C 564 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP11P36026 TSC10YBR265W 963 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP11P36026 GAP1YKR039W 1809 nt10.85□□□□□ -0.67
UBP11P36026 YLR279WYLR279W 390 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP11P36026 RTN2YDL204W 1182 nt10.81□□□□□ -0.68
UBP11P36026 MSB4YOL112W 1479 nt10.79□□□□□ -0.68
UBP11P36026 YKR005CYKR005C 1578 nt10.78□□□□□ -0.68
UBP11P36026 RIB3YDR487C 627 nt10.77□□□□□ -0.69
UBP11P36026 YGR259CYGR259C 441 nt10.76□□□□□ -0.69
UBP11P36026 BOR1YNL275W 1731 nt10.75□□□□□ -0.69
UBP11P36026 HSP60YLR259C 1719 nt10.74□□□□□ -0.69
UBP11P36026 RAD51YER095W 1203 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP11P36026 UTR1YJR049C 1593 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP11P36026 DIF1YLR437C 402 nt10.72□□□□□ -0.69
UBP11P36026 ZTA1YBR046C 1005 nt10.71□□□□□ -0.69
UBP11P36026 PRP4YPR178W 1398 nt10.7□□□□□ -0.7
UBP11P36026 FIT3YOR383C 615 nt10.7□□□□□ -0.7
UBP11P36026 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.68□□□□□ -0.7
UBP11P36026 MTG2YHR168W 1557 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP11P36026 RPM1RPM1 483 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP11P36026 YJL225CYJL225C 5277 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP11P36026 DPS1YLL018C 1674 nt10.64□□□□□ -0.71
UBP11P36026 YAR028WYAR028W 705 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP11P36026 AKR2YOR034C 2250 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP11P36026 ADH1YOL086C 1047 nt10.61□□□□□ -0.71
UBP11P36026 MCH5YOR306C 1566 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP11P36026 PRM5YIL117C 957 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP11P36026 ALP1YNL270C 1722 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP11P36026 GND1YHR183W 1470 nt10.58□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YJL195CYJL195C 702 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 LOT5YKL183W 921 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.57□□□□□ -0.72
UBP11P36026 FUN14YAL008W 597 nt10.56□□□□□ -0.72
UBP11P36026 AAC1YMR056C 930 nt10.56□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YNR029CYNR029C 1290 nt10.56□□□□□ -0.72
UBP11P36026 STE4YOR212W 1272 nt10.56□□□□□ -0.72
UBP11P36026 APT2YDR441C 546 nt10.55□□□□□ -0.72
UBP11P36026 BMT6YLR063W 1098 nt10.55□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YLR349WYLR349W 507 nt10.55□□□□□ -0.72
UBP11P36026 SMM1YNR015W 1155 nt10.54□□□□□ -0.72
UBP11P36026 YPI1YFR003C 468 nt10.52□□□□□ -0.73
UBP11P36026 SNF1YDR477W 1902 nt10.51□□□□□ -0.73
UBP11P36026 IRC24YIR036C 792 nt10.5□□□□□ -0.73
UBP11P36026 UGA4YDL210W 1716 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP11P36026 FCY21YER060W 1587 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP11P36026 SED1YDR077W 1017 nt10.45□□□□□ -0.74
UBP11P36026 SAM35YHR083W 990 nt10.44□□□□□ -0.74
UBP11P36026 RIB2YOL066C 1776 nt10.43□□□□□ -0.74
UBP11P36026 ADH7YCR105W 1086 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP11P36026 PAU15YIR041W 375 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP11P36026 LIP1YMR298W 453 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP11P36026 GPN2YOR262W 1044 nt10.42□□□□□ -0.74
UBP11P36026 YPL251WYPL251W 303 nt10.41□□□□□ -0.74
UBP11P36026 DBP1YPL119C 1854 nt10.4□□□□□ -0.74
UBP11P36026 PRY1YJL079C 900 nt10.4□□□□□ -0.74
UBP11P36026 ALG12YNR030W 1656 nt10.4□□□□□ -0.74
UBP11P36026 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.39□□□□□ -0.75
UBP11P36026 YEL008WYEL008W 381 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP11P36026 HIF1YLL022C 1158 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP11P36026 YBL086CYBL086C 1401 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP11P36026 ALD4YOR374W 1560 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP11P36026 YJL055WYJL055W 738 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP11P36026 HXT1YHR094C 1713 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP11P36026 YMR103CYMR103C 363 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP11P36026 BRR1YPR057W 1026 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP11P36026 HXT12YIL170W 1374 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP11P36026 BIO5YNR056C 1686 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP11P36026 MEP3YPR138C 1470 nt10.32□□□□□ -0.76
UBP11P36026 VRG4YGL225W 1014 nt10.32□□□□□ -0.76
UBP11P36026 LEU9YOR108W 1815 nt10.31□□□□□ -0.76
UBP11P36026 CPD1YGR247W 720 nt10.3□□□□□ -0.76
UBP11P36026 CSM1YCR086W 573 nt10.29□□□□□ -0.76
UBP11P36026 TOA2YKL058W 369 nt10.29□□□□□ -0.76
UBP11P36026 GND2YGR256W 1479 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP11P36026 SHY1YGR112W 1170 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP11P36026 UFO1YML088W 2007 nt10.21□□□□□ -0.77
UBP11P36026 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.21□□□□□ -0.78
UBP11P36026 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.5 ms