Protein–RNA interactions for Protein: P32643

TMT1, Trans-aconitate 3-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMT1P32643 SDH5YOL071W 489 nt10.76□□□□□ -0.69
TMT1P32643 POM34YLR018C 900 nt10.75□□□□□ -0.69
TMT1P32643 PRO1YDR300C 1287 nt10.72□□□□□ -0.69
TMT1P32643 UTH1YKR042W 1098 nt10.72□□□□□ -0.69
TMT1P32643 HIP1YGR191W 1812 nt10.72□□□□□ -0.69
TMT1P32643 BOR1YNL275W 1731 nt10.7□□□□□ -0.7
TMT1P32643 SAM1YLR180W 1149 nt10.69□□□□□ -0.7
TMT1P32643 YML089CYML089C 369 nt10.68□□□□□ -0.7
TMT1P32643 LSC2YGR244C 1284 nt10.67□□□□□ -0.7
TMT1P32643 NRT1YOR071C 1797 nt10.67□□□□□ -0.7
TMT1P32643 ATG15YCR068W 1563 nt10.65□□□□□ -0.7
TMT1P32643 RAD23YEL037C 1197 nt10.65□□□□□ -0.7
TMT1P32643 TSC10YBR265W 963 nt10.64□□□□□ -0.71
TMT1P32643 YKR005CYKR005C 1578 nt10.64□□□□□ -0.71
TMT1P32643 PRP4YPR178W 1398 nt10.64□□□□□ -0.71
TMT1P32643 TIF6YPR016C 738 nt10.63□□□□□ -0.71
TMT1P32643 CAB5YDR196C 726 nt10.62□□□□□ -0.71
TMT1P32643 YGR012WYGR012W 1182 nt10.62□□□□□ -0.71
TMT1P32643 MET28YIR017C 564 nt10.61□□□□□ -0.71
TMT1P32643 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.61□□□□□ -0.71
TMT1P32643 ARP6YLR085C 1317 nt10.59□□□□□ -0.71
TMT1P32643 YGR259CYGR259C 441 nt10.59□□□□□ -0.71
TMT1P32643 DPS1YLL018C 1674 nt10.57□□□□□ -0.72
TMT1P32643 GAP1YKR039W 1809 nt10.56□□□□□ -0.72
TMT1P32643 NVJ2YPR091C 2313 nt10.55□□□□□ -0.72
TMT1P32643 RIB3YDR487C 627 nt10.55□□□□□ -0.72
TMT1P32643 YLR279WYLR279W 390 nt10.55□□□□□ -0.72
TMT1P32643 PLB1YMR008C 1995 nt10.53□□□□□ -0.72
TMT1P32643 RTN2YDL204W 1182 nt10.52□□□□□ -0.73
TMT1P32643 MSB4YOL112W 1479 nt10.51□□□□□ -0.73
TMT1P32643 FIT3YOR383C 615 nt10.49□□□□□ -0.73
TMT1P32643 BMT6YLR063W 1098 nt10.48□□□□□ -0.73
TMT1P32643 RAD51YER095W 1203 nt10.47□□□□□ -0.73
TMT1P32643 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.47□□□□□ -0.73
TMT1P32643 AAC1YMR056C 930 nt10.44□□□□□ -0.74
TMT1P32643 SNF1YDR477W 1902 nt10.44□□□□□ -0.74
TMT1P32643 DIF1YLR437C 402 nt10.41□□□□□ -0.74
TMT1P32643 UTR1YJR049C 1593 nt10.39□□□□□ -0.75
TMT1P32643 STE4YOR212W 1272 nt10.39□□□□□ -0.75
TMT1P32643 IRC24YIR036C 792 nt10.38□□□□□ -0.75
TMT1P32643 YJL195CYJL195C 702 nt10.38□□□□□ -0.75
TMT1P32643 YAR028WYAR028W 705 nt10.38□□□□□ -0.75
TMT1P32643 ZTA1YBR046C 1005 nt10.38□□□□□ -0.75
TMT1P32643 ADH1YOL086C 1047 nt10.37□□□□□ -0.75
TMT1P32643 FUN14YAL008W 597 nt10.36□□□□□ -0.75
TMT1P32643 ALP1YNL270C 1722 nt10.36□□□□□ -0.75
TMT1P32643 MTG2YHR168W 1557 nt10.35□□□□□ -0.75
TMT1P32643 LOT5YKL183W 921 nt10.35□□□□□ -0.75
TMT1P32643 YLR349WYLR349W 507 nt10.35□□□□□ -0.75
TMT1P32643 GND1YHR183W 1470 nt10.35□□□□□ -0.75
TMT1P32643 AKR2YOR034C 2250 nt10.35□□□□□ -0.75
TMT1P32643 YNR029CYNR029C 1290 nt10.34□□□□□ -0.75
TMT1P32643 YPI1YFR003C 468 nt10.33□□□□□ -0.76
TMT1P32643 BIO5YNR056C 1686 nt10.31□□□□□ -0.76
TMT1P32643 PRM5YIL117C 957 nt10.31□□□□□ -0.76
TMT1P32643 ALG12YNR030W 1656 nt10.31□□□□□ -0.76
TMT1P32643 APT2YDR441C 546 nt10.29□□□□□ -0.76
TMT1P32643 ADH7YCR105W 1086 nt10.27□□□□□ -0.77
TMT1P32643 SMM1YNR015W 1155 nt10.27□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.25□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.25□□□□□ -0.77
TMT1P32643 PAU15YIR041W 375 nt10.25□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.25□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.25□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.25□□□□□ -0.77
TMT1P32643 SAM35YHR083W 990 nt10.23□□□□□ -0.77
TMT1P32643 GPN2YOR262W 1044 nt10.23□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YJL225CYJL225C 5277 nt10.23□□□□□ -0.77
TMT1P32643 RPM1RPM1 483 nt10.22□□□□□ -0.77
TMT1P32643 FCY21YER060W 1587 nt10.22□□□□□ -0.77
TMT1P32643 YEL008WYEL008W 381 nt10.2□□□□□ -0.78
TMT1P32643 SED1YDR077W 1017 nt10.19□□□□□ -0.78
TMT1P32643 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.18□□□□□ -0.78
TMT1P32643 RIB2YOL066C 1776 nt10.18□□□□□ -0.78
TMT1P32643 UGA4YDL210W 1716 nt10.17□□□□□ -0.78
TMT1P32643 HIF1YLL022C 1158 nt10.16□□□□□ -0.78
TMT1P32643 ALD4YOR374W 1560 nt10.15□□□□□ -0.78
TMT1P32643 PRY1YJL079C 900 nt10.15□□□□□ -0.78
TMT1P32643 LIP1YMR298W 453 nt10.15□□□□□ -0.78
TMT1P32643 CPD1YGR247W 720 nt10.13□□□□□ -0.79
TMT1P32643 VRG4YGL225W 1014 nt10.1□□□□□ -0.79
TMT1P32643 YPL251WYPL251W 303 nt10.09□□□□□ -0.79
TMT1P32643 NAR1YNL240C 1476 nt10.09□□□□□ -0.79
TMT1P32643 DBP1YPL119C 1854 nt10.08□□□□□ -0.8
TMT1P32643 HXT12YIL170W 1374 nt10.08□□□□□ -0.8
TMT1P32643 PBP1YGR178C 2169 nt10.08□□□□□ -0.8
TMT1P32643 YJL055WYJL055W 738 nt10.07□□□□□ -0.8
TMT1P32643 HXT1YHR094C 1713 nt10.06□□□□□ -0.8
TMT1P32643 YBL086CYBL086C 1401 nt10.06□□□□□ -0.8
TMT1P32643 YMR103CYMR103C 363 nt10.05□□□□□ -0.8
TMT1P32643 BRR1YPR057W 1026 nt10.05□□□□□ -0.8
TMT1P32643 MEP3YPR138C 1470 nt10.04□□□□□ -0.8
TMT1P32643 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.04□□□□□ -0.8
TMT1P32643 ESS1YJR017C 513 nt10.04□□□□□ -0.8
TMT1P32643 TOA2YKL058W 369 nt10.03□□□□□ -0.8
TMT1P32643 MCH5YOR306C 1566 nt10.02□□□□□ -0.81
TMT1P32643 LEU9YOR108W 1815 nt10.02□□□□□ -0.81
TMT1P32643 CSM1YCR086W 573 nt10□□□□□ -0.81
TMT1P32643 CYT2YKL087C 675 nt9.99□□□□□ -0.81
TMT1P32643 UME6YDR207C 2511 nt9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.7 ms