Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PTPRMP28827 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRMP28827 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRMP28827 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PTPRMP28827 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PTPRMP28827 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PTPRMP28827 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PTPRMP28827 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRMP28827 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRMP28827 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRMP28827 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
PTPRMP28827 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PTPRMP28827 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRMP28827 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PTPRMP28827 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PTPRMP28827 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PTPRMP28827 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.07■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
PTPRMP28827 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PTPRMP28827 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PTPRMP28827 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PTPRMP28827 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PTPRMP28827 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PTPRMP28827 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PTPRMP28827 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
PTPRMP28827 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PTPRMP28827 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PTPRMP28827 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PTPRMP28827 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PTPRMP28827 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
PTPRMP28827 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
PTPRMP28827 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PTPRMP28827 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PTPRMP28827 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PTPRMP28827 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PTPRMP28827 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PTPRMP28827 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PTPRMP28827 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PTPRMP28827 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PTPRMP28827 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms