Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB6P28072 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB6P28072 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMB6P28072 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMB6P28072 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB6P28072 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB6P28072 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB6P28072 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms