Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALRP27797 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALRP27797 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALRP27797 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALRP27797 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALRP27797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALRP27797 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALRP27797 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALRP27797 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALRP27797 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALRP27797 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALRP27797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALRP27797 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALRP27797 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALRP27797 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALRP27797 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALRP27797 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALRP27797 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALRP27797 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALRP27797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALRP27797 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALRP27797 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALRP27797 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALRP27797 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALRP27797 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALRP27797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALRP27797 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CALRP27797 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CALRP27797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALRP27797 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALRP27797 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CALRP27797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CALRP27797 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALRP27797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALRP27797 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CALRP27797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CALRP27797 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALRP27797 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CALRP27797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CALRP27797 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CALRP27797 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALRP27797 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALRP27797 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CALRP27797 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALRP27797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALRP27797 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALRP27797 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALRP27797 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALRP27797 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALRP27797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALRP27797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALRP27797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALRP27797 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALRP27797 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALRP27797 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALRP27797 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALRP27797 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALRP27797 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALRP27797 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALRP27797 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALRP27797 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALRP27797 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALRP27797 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALRP27797 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALRP27797 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALRP27797 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALRP27797 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALRP27797 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALRP27797 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALRP27797 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALRP27797 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALRP27797 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALRP27797 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALRP27797 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALRP27797 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALRP27797 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALRP27797 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALRP27797 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALRP27797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALRP27797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALRP27797 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALRP27797 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALRP27797 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALRP27797 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CALRP27797 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALRP27797 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALRP27797 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALRP27797 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALRP27797 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALRP27797 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALRP27797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALRP27797 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALRP27797 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALRP27797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms