Protein–RNA interactions for Protein: P24276

SSD1, Protein SSD1, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSD1P24276 ARP6YLR085C 1317 nt10.8□□□□□ -0.68
SSD1P24276 BSP1YPR171W 1731 nt10.79□□□□□ -0.68
SSD1P24276 YML089CYML089C 369 nt10.79□□□□□ -0.68
SSD1P24276 TOM6YOR045W 186 nt10.79□□□□□ -0.68
SSD1P24276 RTN2YDL204W 1182 nt10.78□□□□□ -0.68
SSD1P24276 PRO1YDR300C 1287 nt10.77□□□□□ -0.69
SSD1P24276 RPS14BYJL191W 417 nt10.77□□□□□ -0.69
SSD1P24276 CLB6YGR109C 1143 nt10.76□□□□□ -0.69
SSD1P24276 RBG2YGR173W 1107 nt10.76□□□□□ -0.69
SSD1P24276 HIP1YGR191W 1812 nt10.76□□□□□ -0.69
SSD1P24276 UTH1YKR042W 1098 nt10.74□□□□□ -0.69 RIP-Chip
SSD1P24276 SSN3YPL042C 1668 nt10.73□□□□□ -0.69
SSD1P24276 PEX2YJL210W 816 nt10.73□□□□□ -0.69
SSD1P24276 HSP60YLR259C 1719 nt10.72□□□□□ -0.69
SSD1P24276 YMR226CYMR226C 804 nt10.72□□□□□ -0.69
SSD1P24276 YKR005CYKR005C 1578 nt10.71□□□□□ -0.69
SSD1P24276 ATG15YCR068W 1563 nt10.7□□□□□ -0.7
SSD1P24276 TIF6YPR016C 738 nt10.7□□□□□ -0.7
SSD1P24276 YGR259CYGR259C 441 nt10.68□□□□□ -0.7
SSD1P24276 PLB1YMR008C 1995 nt10.68□□□□□ -0.7
SSD1P24276 GAP1YKR039W 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
SSD1P24276 NRT1YOR071C 1797 nt10.67□□□□□ -0.7
SSD1P24276 MET28YIR017C 564 nt10.66□□□□□ -0.7
SSD1P24276 PRP4YPR178W 1398 nt10.65□□□□□ -0.7 RIP-Chip
SSD1P24276 YLR111WYLR111W 333 nt10.63□□□□□ -0.71
SSD1P24276 SDH5YOL071W 489 nt10.63□□□□□ -0.71
SSD1P24276 TSC10YBR265W 963 nt10.63□□□□□ -0.71
SSD1P24276 NME1NME1 340 nt10.62□□□□□ -0.71
SSD1P24276 RAD23YEL037C 1197 nt10.61□□□□□ -0.71
SSD1P24276 BOR1YNL275W 1731 nt10.61□□□□□ -0.71
SSD1P24276 DPS1YLL018C 1674 nt10.58□□□□□ -0.72
SSD1P24276 YGR012WYGR012W 1182 nt10.57□□□□□ -0.72
SSD1P24276 BMT6YLR063W 1098 nt10.57□□□□□ -0.72
SSD1P24276 FIT3YOR383C 615 nt10.57□□□□□ -0.72 RIP-Chip
SSD1P24276 YLR279WYLR279W 390 nt10.55□□□□□ -0.72
SSD1P24276 DIF1YLR437C 402 nt10.54□□□□□ -0.72
SSD1P24276 UTR1YJR049C 1593 nt10.53□□□□□ -0.72
SSD1P24276 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.53□□□□□ -0.72
SSD1P24276 CAB5YDR196C 726 nt10.51□□□□□ -0.73
SSD1P24276 RIB3YDR487C 627 nt10.5□□□□□ -0.73
SSD1P24276 IRC24YIR036C 792 nt10.5□□□□□ -0.73
SSD1P24276 YAR028WYAR028W 705 nt10.49□□□□□ -0.73
SSD1P24276 SAM1YLR180W 1149 nt10.48□□□□□ -0.73
SSD1P24276 MSB4YOL112W 1479 nt10.48□□□□□ -0.73
SSD1P24276 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.47□□□□□ -0.73
SSD1P24276 AAC1YMR056C 930 nt10.46□□□□□ -0.73
SSD1P24276 ALP1YNL270C 1722 nt10.44□□□□□ -0.74
SSD1P24276 MTG2YHR168W 1557 nt10.43□□□□□ -0.74
SSD1P24276 PRM5YIL117C 957 nt10.42□□□□□ -0.74
SSD1P24276 ZTA1YBR046C 1005 nt10.42□□□□□ -0.74
SSD1P24276 SNF1YDR477W 1902 nt10.42□□□□□ -0.74
SSD1P24276 UME6YDR207C 2511 nt10.42□□□□□ -0.74
SSD1P24276 SAM35YHR083W 990 nt10.41□□□□□ -0.74
SSD1P24276 AKR2YOR034C 2250 nt10.4□□□□□ -0.74
SSD1P24276 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.39□□□□□ -0.75
SSD1P24276 Q0010Q0010 387 nt10.39□□□□□ -0.75
SSD1P24276 SED1YDR077W 1017 nt10.33□□□□□ -0.76
SSD1P24276 GND1YHR183W 1470 nt10.31□□□□□ -0.76
SSD1P24276 MCM5YLR274W 2328 nt10.31□□□□□ -0.76
SSD1P24276 ALD4YOR374W 1560 nt10.3□□□□□ -0.76
SSD1P24276 FCY21YER060W 1587 nt10.29□□□□□ -0.76
SSD1P24276 DBP1YPL119C 1854 nt10.28□□□□□ -0.76
SSD1P24276 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SSD1P24276 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SSD1P24276 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SSD1P24276 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SSD1P24276 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.28□□□□□ -0.76
SSD1P24276 YPI1YFR003C 468 nt10.27□□□□□ -0.77
SSD1P24276 LOT5YKL183W 921 nt10.27□□□□□ -0.77
SSD1P24276 MAS1YLR163C 1389 nt10.26□□□□□ -0.77
SSD1P24276 LIP1YMR298W 453 nt10.26□□□□□ -0.77
SSD1P24276 BIO5YNR056C 1686 nt10.25□□□□□ -0.77
SSD1P24276 HIF1YLL022C 1158 nt10.25□□□□□ -0.77
SSD1P24276 APT2YDR441C 546 nt10.24□□□□□ -0.77 RIP-Chip
SSD1P24276 ALG12YNR030W 1656 nt10.23□□□□□ -0.77
SSD1P24276 ADH1YOL086C 1047 nt10.23□□□□□ -0.77
SSD1P24276 HXT1YHR094C 1713 nt10.22□□□□□ -0.77
SSD1P24276 SMM1YNR015W 1155 nt10.21□□□□□ -0.77
SSD1P24276 YBL086CYBL086C 1401 nt10.21□□□□□ -0.78
SSD1P24276 UGA4YDL210W 1716 nt10.2□□□□□ -0.78
SSD1P24276 YNR029CYNR029C 1290 nt10.2□□□□□ -0.78
SSD1P24276 YPL251WYPL251W 303 nt10.2□□□□□ -0.78
SSD1P24276 YJL195CYJL195C 702 nt10.19□□□□□ -0.78
SSD1P24276 FUN14YAL008W 597 nt10.18□□□□□ -0.78
SSD1P24276 LEU9YOR108W 1815 nt10.18□□□□□ -0.78
SSD1P24276 PRY1YJL079C 900 nt10.16□□□□□ -0.78 RIP-Chip
SSD1P24276 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.14□□□□□ -0.79
SSD1P24276 RAD51YER095W 1203 nt10.14□□□□□ -0.79
SSD1P24276 STE4YOR212W 1272 nt10.14□□□□□ -0.79
SSD1P24276 BRR1YPR057W 1026 nt10.14□□□□□ -0.79
SSD1P24276 GID7YCL039W 2238 nt10.14□□□□□ -0.79
SSD1P24276 YLR349WYLR349W 507 nt10.13□□□□□ -0.79
SSD1P24276 HXT12YIL170W 1374 nt10.13□□□□□ -0.79
SSD1P24276 SHY1YGR112W 1170 nt10.1□□□□□ -0.79
SSD1P24276 YJR154WYJR154W 1041 nt10.1□□□□□ -0.79
SSD1P24276 MEP3YPR138C 1470 nt10.1□□□□□ -0.79
SSD1P24276 RSC4YKR008W 1878 nt10.09□□□□□ -0.79
SSD1P24276 TOA2YKL058W 369 nt10.09□□□□□ -0.79
SSD1P24276 ESBP6YNL125C 2022 nt10.09□□□□□ -0.79
SSD1P24276 YMR103CYMR103C 363 nt10.08□□□□□ -0.8
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