Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5AP20339 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5AP20339 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5AP20339 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5AP20339 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5AP20339 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5AP20339 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5AP20339 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB5AP20339 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB5AP20339 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB5AP20339 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB5AP20339 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB5AP20339 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5AP20339 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB5AP20339 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB5AP20339 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB5AP20339 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB5AP20339 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB5AP20339 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB5AP20339 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB5AP20339 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB5AP20339 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB5AP20339 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms