Protein–RNA interactions for Protein: P13693

TPT1, Translationally-controlled tumor protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPT1P13693 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPT1P13693 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPT1P13693 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPT1P13693 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPT1P13693 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPT1P13693 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPT1P13693 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPT1P13693 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPT1P13693 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPT1P13693 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPT1P13693 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPT1P13693 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPT1P13693 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPT1P13693 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPT1P13693 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPT1P13693 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPT1P13693 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPT1P13693 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPT1P13693 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPT1P13693 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPT1P13693 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPT1P13693 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPT1P13693 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPT1P13693 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPT1P13693 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPT1P13693 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPT1P13693 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPT1P13693 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPT1P13693 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPT1P13693 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPT1P13693 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPT1P13693 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPT1P13693 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPT1P13693 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPT1P13693 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPT1P13693 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPT1P13693 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPT1P13693 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPT1P13693 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPT1P13693 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPT1P13693 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPT1P13693 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPT1P13693 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPT1P13693 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPT1P13693 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPT1P13693 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPT1P13693 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPT1P13693 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPT1P13693 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPT1P13693 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPT1P13693 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPT1P13693 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPT1P13693 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPT1P13693 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPT1P13693 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPT1P13693 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPT1P13693 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPT1P13693 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPT1P13693 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPT1P13693 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPT1P13693 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPT1P13693 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPT1P13693 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPT1P13693 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPT1P13693 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPT1P13693 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPT1P13693 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPT1P13693 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPT1P13693 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPT1P13693 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPT1P13693 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPT1P13693 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPT1P13693 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPT1P13693 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPT1P13693 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPT1P13693 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPT1P13693 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPT1P13693 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPT1P13693 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPT1P13693 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPT1P13693 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPT1P13693 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPT1P13693 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPT1P13693 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPT1P13693 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPT1P13693 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPT1P13693 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPT1P13693 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPT1P13693 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPT1P13693 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPT1P13693 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPT1P13693 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPT1P13693 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms