Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CENPBP07199 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CENPBP07199 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CENPBP07199 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CENPBP07199 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CENPBP07199 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CENPBP07199 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CENPBP07199 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CENPBP07199 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CENPBP07199 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CENPBP07199 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CENPBP07199 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CENPBP07199 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
CENPBP07199 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CENPBP07199 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CENPBP07199 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CENPBP07199 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CENPBP07199 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CENPBP07199 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CENPBP07199 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CENPBP07199 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CENPBP07199 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CENPBP07199 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CENPBP07199 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CENPBP07199 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CENPBP07199 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CENPBP07199 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CENPBP07199 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CENPBP07199 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CENPBP07199 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CENPBP07199 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CENPBP07199 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CENPBP07199 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CENPBP07199 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CENPBP07199 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CENPBP07199 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CENPBP07199 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CENPBP07199 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CENPBP07199 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CENPBP07199 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CENPBP07199 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CENPBP07199 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CENPBP07199 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CENPBP07199 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CENPBP07199 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CENPBP07199 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CENPBP07199 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CENPBP07199 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CENPBP07199 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CENPBP07199 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CENPBP07199 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CENPBP07199 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CENPBP07199 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CENPBP07199 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CENPBP07199 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CENPBP07199 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CENPBP07199 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CENPBP07199 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CENPBP07199 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CENPBP07199 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CENPBP07199 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CENPBP07199 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CENPBP07199 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CENPBP07199 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CENPBP07199 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CENPBP07199 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CENPBP07199 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CENPBP07199 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CENPBP07199 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CENPBP07199 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CENPBP07199 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CENPBP07199 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CENPBP07199 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CENPBP07199 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CENPBP07199 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CENPBP07199 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CENPBP07199 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CENPBP07199 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CENPBP07199 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CENPBP07199 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CENPBP07199 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CENPBP07199 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CENPBP07199 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CENPBP07199 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CENPBP07199 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CENPBP07199 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CENPBP07199 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CENPBP07199 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CENPBP07199 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CENPBP07199 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CENPBP07199 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CENPBP07199 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CENPBP07199 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CENPBP07199 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CENPBP07199 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CENPBP07199 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CENPBP07199 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CENPBP07199 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CENPBP07199 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CENPBP07199 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms