Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD74P04233 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD74P04233 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD74P04233 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD74P04233 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD74P04233 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD74P04233 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD74P04233 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD74P04233 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD74P04233 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD74P04233 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD74P04233 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD74P04233 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD74P04233 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD74P04233 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD74P04233 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD74P04233 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD74P04233 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD74P04233 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD74P04233 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD74P04233 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD74P04233 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD74P04233 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD74P04233 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD74P04233 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD74P04233 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD74P04233 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD74P04233 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD74P04233 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD74P04233 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD74P04233 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD74P04233 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD74P04233 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD74P04233 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD74P04233 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD74P04233 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD74P04233 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD74P04233 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD74P04233 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD74P04233 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD74P04233 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD74P04233 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD74P04233 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD74P04233 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD74P04233 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD74P04233 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD74P04233 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD74P04233 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD74P04233 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD74P04233 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD74P04233 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD74P04233 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD74P04233 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD74P04233 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD74P04233 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD74P04233 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD74P04233 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD74P04233 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD74P04233 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD74P04233 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD74P04233 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD74P04233 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD74P04233 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD74P04233 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD74P04233 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD74P04233 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD74P04233 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD74P04233 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD74P04233 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD74P04233 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD74P04233 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD74P04233 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD74P04233 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD74P04233 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD74P04233 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD74P04233 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD74P04233 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD74P04233 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD74P04233 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD74P04233 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD74P04233 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD74P04233 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD74P04233 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD74P04233 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD74P04233 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD74P04233 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD74P04233 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD74P04233 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD74P04233 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD74P04233 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD74P04233 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD74P04233 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD74P04233 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD74P04233 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms