Protein–RNA interactions for Protein: P01569

IFNA5, Interferon alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA5P01569 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFNA5P01569 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFNA5P01569 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IFNA5P01569 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA5P01569 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNA5P01569 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA5P01569 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA5P01569 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA5P01569 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms