Protein–RNA interactions for Protein: O75880

SCO1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO1O75880 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCO1O75880 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO1O75880 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO1O75880 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO1O75880 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO1O75880 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCO1O75880 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO1O75880 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCO1O75880 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO1O75880 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO1O75880 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO1O75880 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO1O75880 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCO1O75880 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCO1O75880 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCO1O75880 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCO1O75880 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCO1O75880 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO1O75880 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO1O75880 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO1O75880 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCO1O75880 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO1O75880 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO1O75880 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO1O75880 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCO1O75880 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO1O75880 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO1O75880 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCO1O75880 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO1O75880 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO1O75880 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCO1O75880 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO1O75880 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO1O75880 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCO1O75880 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO1O75880 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCO1O75880 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCO1O75880 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCO1O75880 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCO1O75880 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO1O75880 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO1O75880 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCO1O75880 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO1O75880 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCO1O75880 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCO1O75880 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCO1O75880 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCO1O75880 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO1O75880 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCO1O75880 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO1O75880 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO1O75880 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCO1O75880 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCO1O75880 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO1O75880 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCO1O75880 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCO1O75880 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCO1O75880 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO1O75880 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCO1O75880 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO1O75880 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCO1O75880 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCO1O75880 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO1O75880 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO1O75880 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO1O75880 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCO1O75880 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCO1O75880 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO1O75880 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO1O75880 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO1O75880 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCO1O75880 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCO1O75880 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCO1O75880 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCO1O75880 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCO1O75880 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCO1O75880 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCO1O75880 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO1O75880 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCO1O75880 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO1O75880 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO1O75880 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCO1O75880 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO1O75880 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO1O75880 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO1O75880 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO1O75880 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO1O75880 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCO1O75880 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCO1O75880 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO1O75880 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCO1O75880 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO1O75880 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCO1O75880 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms