Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX3O60493 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX3O60493 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX3O60493 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX3O60493 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNX3O60493 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX3O60493 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX3O60493 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX3O60493 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX3O60493 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX3O60493 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX3O60493 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX3O60493 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX3O60493 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX3O60493 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX3O60493 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX3O60493 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX3O60493 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX3O60493 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX3O60493 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX3O60493 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX3O60493 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX3O60493 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX3O60493 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX3O60493 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX3O60493 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX3O60493 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX3O60493 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX3O60493 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX3O60493 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX3O60493 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX3O60493 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX3O60493 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX3O60493 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX3O60493 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX3O60493 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX3O60493 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX3O60493 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX3O60493 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX3O60493 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX3O60493 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX3O60493 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX3O60493 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX3O60493 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX3O60493 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX3O60493 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX3O60493 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX3O60493 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX3O60493 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX3O60493 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX3O60493 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX3O60493 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX3O60493 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX3O60493 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX3O60493 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX3O60493 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX3O60493 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX3O60493 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX3O60493 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX3O60493 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX3O60493 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX3O60493 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX3O60493 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX3O60493 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX3O60493 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX3O60493 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX3O60493 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX3O60493 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX3O60493 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX3O60493 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX3O60493 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX3O60493 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX3O60493 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX3O60493 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX3O60493 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX3O60493 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX3O60493 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX3O60493 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX3O60493 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX3O60493 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX3O60493 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX3O60493 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX3O60493 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX3O60493 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX3O60493 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX3O60493 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX3O60493 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX3O60493 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX3O60493 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX3O60493 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX3O60493 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX3O60493 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX3O60493 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX3O60493 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX3O60493 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX3O60493 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX3O60493 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX3O60493 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX3O60493 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX3O60493 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms