Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGPSO00116 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AGPSO00116 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGPSO00116 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGPSO00116 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGPSO00116 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGPSO00116 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGPSO00116 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGPSO00116 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGPSO00116 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGPSO00116 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGPSO00116 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGPSO00116 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGPSO00116 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGPSO00116 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGPSO00116 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGPSO00116 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGPSO00116 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGPSO00116 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGPSO00116 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGPSO00116 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGPSO00116 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGPSO00116 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGPSO00116 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGPSO00116 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGPSO00116 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGPSO00116 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGPSO00116 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGPSO00116 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGPSO00116 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGPSO00116 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGPSO00116 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGPSO00116 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGPSO00116 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AGPSO00116 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AGPSO00116 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGPSO00116 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AGPSO00116 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGPSO00116 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AGPSO00116 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AGPSO00116 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AGPSO00116 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AGPSO00116 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AGPSO00116 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGPSO00116 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGPSO00116 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AGPSO00116 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AGPSO00116 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AGPSO00116 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AGPSO00116 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
AGPSO00116 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGPSO00116 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGPSO00116 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AGPSO00116 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AGPSO00116 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGPSO00116 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AGPSO00116 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGPSO00116 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AGPSO00116 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AGPSO00116 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
AGPSO00116 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AGPSO00116 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGPSO00116 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGPSO00116 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AGPSO00116 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGPSO00116 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AGPSO00116 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGPSO00116 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGPSO00116 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AGPSO00116 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGPSO00116 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AGPSO00116 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGPSO00116 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGPSO00116 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGPSO00116 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGPSO00116 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGPSO00116 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AGPSO00116 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AGPSO00116 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGPSO00116 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AGPSO00116 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGPSO00116 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGPSO00116 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGPSO00116 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGPSO00116 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGPSO00116 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AGPSO00116 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AGPSO00116 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGPSO00116 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AGPSO00116 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGPSO00116 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGPSO00116 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AGPSO00116 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AGPSO00116 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AGPSO00116 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AGPSO00116 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGPSO00116 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGPSO00116 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGPSO00116 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AGPSO00116 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms