Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PQ18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PQ18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PQ18 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PQ18 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PQ18 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PQ18 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PQ18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E9PQ18 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E9PQ18 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
E9PQ18 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PQ18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E9PQ18 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PQ18 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PQ18 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PQ18 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E9PQ18 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E9PQ18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E9PQ18 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PQ18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
E9PQ18 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E9PQ18 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PQ18 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E9PQ18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PQ18 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E9PQ18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E9PQ18 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PQ18 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E9PQ18 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PQ18 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PQ18 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E9PQ18 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E9PQ18 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PQ18 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E9PQ18 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E9PQ18 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PQ18 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PQ18 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E9PQ18 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PQ18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PQ18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PQ18 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PQ18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PQ18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PQ18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PQ18 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PQ18 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PQ18 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PQ18 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PQ18 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PQ18 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PQ18 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PQ18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PQ18 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PQ18 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PQ18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PQ18 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E9PQ18 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PQ18 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PQ18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E9PQ18 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PQ18 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PQ18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PQ18 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E9PQ18 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PQ18 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E9PQ18 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PQ18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E9PQ18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PQ18 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PQ18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E9PQ18 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PQ18 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PQ18 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E9PQ18 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PQ18 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PQ18 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PQ18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PQ18 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PQ18 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PQ18 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PQ18 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PQ18 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PQ18 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PQ18 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PQ18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PQ18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PQ18 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PQ18 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PQ18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PQ18 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PQ18 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PQ18 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PQ18 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PQ18 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PQ18 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PQ18 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PQ18 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PQ18 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PQ18 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms